More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1803 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1803  50S ribosomal protein L12P  100 
 
 
123 aa  223  8e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  75 
 
 
124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  73.39 
 
 
124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  72.58 
 
 
124 aa  130  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1700  50S ribosomal protein L7/L12  75.2 
 
 
125 aa  130  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357459  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  69.11 
 
 
123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  71.77 
 
 
124 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  67.48 
 
 
123 aa  127  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0570  50S ribosomal protein L7/L12  66.67 
 
 
123 aa  126  8.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000202265  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  70.63 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  63.28 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  71.77 
 
 
124 aa  124  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  64.17 
 
 
125 aa  124  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  65.85 
 
 
123 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1823  50S ribosomal protein L7/L12  66.94 
 
 
124 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  68 
 
 
125 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  64.23 
 
 
123 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3476  50S ribosomal protein L7/L12  67.46 
 
 
126 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145567  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  68.8 
 
 
125 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  65.04 
 
 
123 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2959  50S ribosomal protein L7/L12  68.8 
 
 
125 aa  121  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585888  normal  0.16288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4016  50S ribosomal protein L7/L12  64.8 
 
 
125 aa  121  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.797485  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  72 
 
 
125 aa  120  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4385  50S ribosomal protein L7/L12  64.8 
 
 
125 aa  121  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  70.4 
 
 
125 aa  120  8e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  67.46 
 
 
126 aa  120  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  69.6 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3840  50S ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00160785  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  62.1 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0266  50S ribosomal protein L7/L12  65.87 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  68.25 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1323  50S ribosomal protein L7/L12  64.8 
 
 
125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.160578 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  59.66 
 
 
121 aa  116  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 
127 aa  116  9e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  65.6 
 
 
125 aa  115  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 
124 aa  115  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1421  50S ribosomal protein L7/L12  64 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927716  normal  0.299454 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  64.29 
 
 
126 aa  114  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  56.3 
 
 
121 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 
123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0746  50S ribosomal protein L7/L12  64.8 
 
 
124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00478946 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0567  50S ribosomal protein L7/L12  62.1 
 
 
124 aa  110  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0030  50S ribosomal protein L7/L12  62.6 
 
 
123 aa  110  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0666406  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  62.7 
 
 
126 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2543  50S ribosomal protein L7/L12  64 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2272  50S ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2360  50S ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0442  ribosomal protein L7/L12  55.38 
 
 
130 aa  108  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1700  50S ribosomal protein L7/L12  65.87 
 
 
125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.906348  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  61.98 
 
 
123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0352  50S ribosomal protein L7/L12  65.87 
 
 
125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0338  50S ribosomal protein L7/L12  65.87 
 
 
125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.826751 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  58.47 
 
 
123 aa  106  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 
126 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 
124 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  61.42 
 
 
127 aa  103  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 
124 aa  102  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  77.78 
 
 
128 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  53.78 
 
 
121 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  63.64 
 
 
124 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1397  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 
127 aa  101  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4677  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
126 aa  101  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0969346  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  67.86 
 
 
123 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  65.79 
 
 
128 aa  101  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  52.5 
 
 
122 aa  100  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  52.5 
 
 
122 aa  100  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
126 aa  100  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  60.36 
 
 
123 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  59.35 
 
 
125 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0480  ribosomal protein L7/L12  60.5 
 
 
121 aa  99  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 
124 aa  98.6  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  63.06 
 
 
123 aa  98.2  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  59.46 
 
 
125 aa  97.8  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  78.87 
 
 
129 aa  97.8  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  55.04 
 
 
129 aa  97.8  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 
128 aa  97.4  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0392  50S ribosomal protein L7/L12  71.23 
 
 
124 aa  97.8  5e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  63.96 
 
 
125 aa  97.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  61.86 
 
 
125 aa  96.7  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2037  50S ribosomal protein L7/L12  62.16 
 
 
125 aa  96.7  9e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0646478  normal  0.703058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1386  50S ribosomal protein L7/L12  74.29 
 
 
121 aa  96.7  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000070815  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  58.56 
 
 
125 aa  95.5  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 
129 aa  94.7  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29840  LSU ribosomal protein L12P  74.29 
 
 
127 aa  94.4  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0790  50S ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 
126 aa  94.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.188773 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  70.83 
 
 
123 aa  94.4  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  54.92 
 
 
127 aa  94  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0233  50S ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 
125 aa  94  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0819772  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  68.06 
 
 
125 aa  93.6  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  63.64 
 
 
124 aa  93.6  8e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  62.73 
 
 
124 aa  93.6  9e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4017  ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 
127 aa  92.8  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712821  normal  0.474419 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  70.83 
 
 
123 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  71.83 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  70.83 
 
 
126 aa  93.2  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  59.32 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2701  ribosomal protein L7/L12  64 
 
 
125 aa  92  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0719525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>