More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1042 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1042  ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 124 aa  224  3e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  68.25 
 
 		 125 aa  124  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  61.9 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  64 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 		 123 aa  116  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1823  50S ribosomal protein L7/L12  64 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  64 
 
 		 124 aa  114  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  63.2 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 		 123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 		 123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  64.29 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0570  50S ribosomal protein L7/L12  64.52 
 
 		 123 aa  110  7.000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000202265  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  58.27 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 		 125 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1323  50S ribosomal protein L7/L12  61.9 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.160578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  60.32 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  60.32 
 
 		 125 aa  107  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  57.48 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  57.5 
 
 		 124 aa  107  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  55.46 
 
 		 121 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  58.46 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  58.27 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1421  50S ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927716  normal  0.299454 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2959  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585888  normal  0.16288 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  50.42 
 
 		 121 aa  103  7e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2272  50S ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2360  50S ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0030  50S ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 		 123 aa  103  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0666406  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  58.47 
 
 		 124 aa  103  8e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  58.33 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  51.67 
 
 		 121 aa  103  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  52.76 
 
 		 127 aa  103  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  60.47 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4677  50S ribosomal protein L7/L12  58.27 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0969346  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  52.76 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  57.48 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  57.48 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3840  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00160785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4385  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1700  50S ribosomal protein L7/L12  60.32 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4016  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.797485  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  61.16 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  53.49 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3476  50S ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 		 126 aa  100  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145567  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  55.08 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  49.17 
 
 		 121 aa  99.4  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2263  50S ribosomal protein L7/L12  57.89 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  49.17 
 
 		 122 aa  98.2  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3190  50S ribosomal protein L7/L12  57.5 
 
 		 124 aa  98.2  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.603289  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  49.17 
 
 		 122 aa  98.2  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  57.5 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0509  50S ribosomal protein L7/L12  60.87 
 
 		 125 aa  97.4  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  58.54 
 
 		 127 aa  97.8  5e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 		 124 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0790  50S ribosomal protein L7/L12  61.9 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.188773 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  56.1 
 
 		 124 aa  96.7  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  52.46 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  52.46 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 		 129 aa  96.7  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3868  50S ribosomal protein L7/L12  57.02 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4017  ribosomal protein L7/L12  51.94 
 
 		 127 aa  95.1  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712821  normal  0.474419 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3247  50S ribosomal protein L7/L12  58.62 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  48.8 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2543  50S ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0318  50S ribosomal protein L7/L12  52.76 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132009  hitchhiker  0.00085028 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0362  50S ribosomal protein L7/L12  59.02 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00344046  hitchhiker  0.0000691271 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 		 124 aa  94.4  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  57.02 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  56.59 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4532  50S ribosomal protein L7/L12  56.03 
 
 		 126 aa  94  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1017  50S ribosomal protein L7/L12  55.75 
 
 		 131 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221809 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1700  50S ribosomal protein L7/L12  57.48 
 
 		 125 aa  93.2  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.906348  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3898  50S ribosomal protein L7/L12  57.76 
 
 		 126 aa  93.6  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0338  50S ribosomal protein L7/L12  57.48 
 
 		 125 aa  93.2  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.826751 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0352  50S ribosomal protein L7/L12  57.48 
 
 		 125 aa  93.2  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2995  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  47.2 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  51.61 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0446  50S ribosomal protein L7/L12  55.46 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690504  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3787  50S ribosomal protein L7/L12  60.36 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229849  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5087  50S ribosomal protein L7/L12  55.46 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167617  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 		 124 aa  92.8  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3468  50S ribosomal protein L7/L12  60.36 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108927  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4757  50S ribosomal protein L7/L12  55.46 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0149649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1913  50S ribosomal protein L7/L12  60.36 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000803393  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0479  50S ribosomal protein L7/L12  55.46 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00592833  hitchhiker  0.00479203 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3179  50S ribosomal protein L7/L12  60.36 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000124958  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3817  50S ribosomal protein L7/L12  60.36 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3755  50S ribosomal protein L7/L12  60.36 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.062938  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0476  50S ribosomal protein L7/L12  55.46 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>