More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1668 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1668  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 126 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0227  ribosomal protein L7/L12  88.1 
 
 		 126 aa  167  5e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0916  ribosomal protein L7/L12  70.08 
 
 		 127 aa  140  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599285  normal  0.231708 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5960  50S ribosomal protein L7/L12  67.97 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4350  ribosomal protein L7/L12  64.39 
 
 		 132 aa  133  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2668  ribosomal protein L7/L12  65.12 
 
 		 129 aa  133  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.555743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17260  LSU ribosomal protein L12P  68.22 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29840  LSU ribosomal protein L12P  70.08 
 
 		 127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20970  50S ribosomal protein L7/L12  65.12 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2655  50S ribosomal protein L7/L12  66.92 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496978  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3934  ribosomal protein L7/L12  69.53 
 
 		 128 aa  130  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4326  ribosomal protein L7/L12  66.67 
 
 		 129 aa  130  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0542  50S ribosomal protein L7/L12  66.17 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251524  normal  0.125779 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2701  ribosomal protein L7/L12  68.25 
 
 		 125 aa  127  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0719525 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23950  LSU ribosomal protein L12P  66.67 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2989  50S ribosomal protein L12P / LSU ribosomal protein L12P  65.87 
 
 		 123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201729  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03680  LSU ribosomal protein L12P  65.65 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.770904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  62.3 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0699  50S ribosomal protein L7/L12  60.31 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0619  ribosomal protein L7/L12  70.08 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0751  ribosomal protein L7/L12  60.31 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.69161  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  67.21 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  59.17 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5115  ribosomal protein L7/L12  62.79 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730152 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3156  50S ribosomal protein L7/L12  62.5 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0298  50S ribosomal protein L12P  64.62 
 
 		 130 aa  117  6e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5100  50S ribosomal protein L7/L12  63.08 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.125465 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4520  ribosomal protein L7/L12  62.6 
 
 		 131 aa  115  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0679  ribosomal protein L7/L12  69.53 
 
 		 128 aa  114  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6058  50S ribosomal protein L7/L12  65.38 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.87538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1171  ribosomal protein L7/L12  64.23 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000534348  unclonable  0.0000000277278 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  65.55 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6636  ribosomal protein L7/L12  60.63 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  54.47 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  54.47 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  63.41 
 
 		 123 aa  110  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1253  50S ribosomal protein L7/L12  60.77 
 
 		 130 aa  110  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0572  50S ribosomal protein L7/L12  66.15 
 
 		 130 aa  110  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  52.03 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0579  ribosomal protein L7/L12  66.02 
 
 		 128 aa  108  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.573662  normal  0.0129016 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  59.32 
 
 		 123 aa  107  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 		 124 aa  107  6e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1073  RplL  65.77 
 
 		 130 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  58.54 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  56.91 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  63.03 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  56.91 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  56.91 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 		 125 aa  104  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  57.98 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  56.67 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  57.48 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  54.1 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  57.81 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10665  50S ribosomal protein L7/L12  63.85 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.67859e-19  normal  0.457138 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  52.46 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  59.52 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3346  50S ribosomal protein L7/L12  56.91 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.80361  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  56.67 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  54.92 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2037  50S ribosomal protein L7/L12  56.1 
 
 		 125 aa  100  8e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0646478  normal  0.703058 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  57.48 
 
 		 127 aa  100  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  57.38 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0446  50S ribosomal protein L7/L12  52.85 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690504  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0476  50S ribosomal protein L7/L12  52.85 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  59.32 
 
 		 123 aa  99.4  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0479  50S ribosomal protein L7/L12  52.85 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00592833  hitchhiker  0.00479203 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  59.5 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4757  50S ribosomal protein L7/L12  52.85 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0149649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  57.72 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  58.54 
 
 		 123 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  56.1 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  56.1 
 
 		 122 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  57.85 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  52.46 
 
 		 122 aa  98.6  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2177  ribosomal protein L7/L12  53.66 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.866659 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0923  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000276114  hitchhiker  0.0000101769 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2073  ribosomal protein L7/L12  57.03 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5087  50S ribosomal protein L7/L12  52.03 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167617  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0995  50S ribosomal protein L7/L12  61.24 
 
 		 129 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  51.2 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0967  50S ribosomal protein L7/L12  61.24 
 
 		 129 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  51.22 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  51.22 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0985  50S ribosomal protein L7/L12  61.24 
 
 		 129 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350838  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0318  50S ribosomal protein L7/L12  57.5 
 
 		 126 aa  97.4  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132009  hitchhiker  0.00085028 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  56.2 
 
 		 126 aa  97.4  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  55.83 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1635  50S ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 		 128 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  61.26 
 
 		 124 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 		 127 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 		 124 aa  97.8  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>