More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1019 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1019  ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 130 aa  238  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5100  50S ribosomal protein L7/L12  83.08 
 
 		 130 aa  161  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.125465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1253  50S ribosomal protein L7/L12  82.31 
 
 		 130 aa  157  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03680  LSU ribosomal protein L12P  76.34 
 
 		 131 aa  156  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.770904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0751  ribosomal protein L7/L12  76.34 
 
 		 131 aa  150  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.69161  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4326  ribosomal protein L7/L12  75.38 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0916  ribosomal protein L7/L12  74.62 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599285  normal  0.231708 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3934  ribosomal protein L7/L12  73.85 
 
 		 128 aa  144  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6636  ribosomal protein L7/L12  71.54 
 
 		 127 aa  144  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0995  50S ribosomal protein L7/L12  86.15 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0967  50S ribosomal protein L7/L12  86.15 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0699  50S ribosomal protein L7/L12  69.7 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0985  50S ribosomal protein L7/L12  86.15 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350838  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0298  50S ribosomal protein L12P  72.52 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10665  50S ribosomal protein L7/L12  78.46 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.67859e-19  normal  0.457138 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6058  50S ribosomal protein L7/L12  71.76 
 
 		 130 aa  130  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.87538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1125  ribosomal protein L7/L12  76.92 
 
 		 130 aa  130  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4520  ribosomal protein L7/L12  71.97 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23950  LSU ribosomal protein L12P  71.54 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2668  ribosomal protein L7/L12  69.23 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.555743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4350  ribosomal protein L7/L12  63.91 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  63.85 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2701  ribosomal protein L7/L12  66.15 
 
 		 125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0719525 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3156  50S ribosomal protein L7/L12  68.46 
 
 		 128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2655  50S ribosomal protein L7/L12  66.41 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496978  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29840  LSU ribosomal protein L12P  70.77 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5960  50S ribosomal protein L7/L12  73.08 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20970  50S ribosomal protein L7/L12  66.15 
 
 		 129 aa  123  8.000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17260  LSU ribosomal protein L12P  72.31 
 
 		 129 aa  123  9e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0542  50S ribosomal protein L7/L12  62.69 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251524  normal  0.125779 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0572  50S ribosomal protein L7/L12  71.76 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0679  ribosomal protein L7/L12  77.69 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2989  50S ribosomal protein L12P / LSU ribosomal protein L12P  64.62 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201729  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  52.31 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5115  ribosomal protein L7/L12  65.38 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730152 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1668  50S ribosomal protein L7/L12  65.38 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1073  RplL  74.81 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0227  ribosomal protein L7/L12  65.38 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  51.97 
 
 		 129 aa  110  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  60.63 
 
 		 123 aa  110  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0579  ribosomal protein L7/L12  65.89 
 
 		 128 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.573662  normal  0.0129016 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  56.49 
 
 		 128 aa  107  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0619  ribosomal protein L7/L12  68.46 
 
 		 127 aa  107  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  59.23 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  62.6 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  62.31 
 
 		 124 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  51.18 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  59.84 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  64.8 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  50.39 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2555  50S ribosomal protein L7/L12  60.63 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  60.63 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  55.38 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  59.06 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 		 125 aa  100  8e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 		 124 aa  100  9e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5087  50S ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167617  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0271  50S ribosomal protein L12P  63.78 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0803416  hitchhiker  0.00134879 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  59.23 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 128 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 128 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1171  ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000534348  unclonable  0.0000000277278 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  49.61 
 
 		 121 aa  99.4  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0446  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690504  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  60.77 
 
 		 129 aa  98.6  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  58.54 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4757  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0149649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0479  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00592833  hitchhiker  0.00479203 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  56.92 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1761  50S ribosomal protein L7/L12  55.38 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0476  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1737  50S ribosomal protein L7/L12  55.38 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 123 aa  97.4  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  56.92 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1820  ribosomal protein L7/L12  56.59 
 
 		 133 aa  97.1  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  46.46 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  46.46 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  47.24 
 
 		 121 aa  96.7  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 124 aa  96.7  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1017  50S ribosomal protein L7/L12  58.14 
 
 		 131 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221809 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  62.2 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3346  50S ribosomal protein L7/L12  51.97 
 
 		 124 aa  94.7  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.80361  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  51.97 
 
 		 125 aa  94.7  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  59.06 
 
 		 122 aa  94.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  58.27 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0463  50S ribosomal protein L7/L12  56.15 
 
 		 128 aa  94.4  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.228162  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0478  50S ribosomal protein L7/L12  56.15 
 
 		 128 aa  94.4  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  51.97 
 
 		 124 aa  94.4  5e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3917  50S ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0631  50S ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.141708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  52.76 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4556  50S ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0500923 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  56.1 
 
 		 126 aa  94  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  51.97 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0618  ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.643875  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  48.82 
 
 		 122 aa  93.6  9e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  57.48 
 
 		 119 aa  93.6  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  56 
 
 		 126 aa  93.6  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>