More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1416 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1416  50S ribosomal protein L12P  100 
 
 
121 aa  223  7e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000264913  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0314  50S ribosomal protein L7/L12  80.99 
 
 
121 aa  142  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000853139  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0272  50S ribosomal protein L7/L12  75.21 
 
 
121 aa  140  7e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.079724  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1301  50S ribosomal protein L7/L12  66.94 
 
 
121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0017753  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0362  50S ribosomal protein L7/L12  68.6 
 
 
120 aa  124  6e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00344046  hitchhiker  0.0000691271 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1386  50S ribosomal protein L7/L12  63.64 
 
 
121 aa  123  9e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000070815  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0568  50S ribosomal protein L7/L12  63.93 
 
 
122 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166247  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  61.67 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  53.66 
 
 
123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  53.66 
 
 
123 aa  107  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0577  50S ribosomal protein L7/L12  61.67 
 
 
122 aa  104  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000019471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0563  50S ribosomal protein L7/L12  61.67 
 
 
122 aa  104  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000998366  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  55.46 
 
 
119 aa  100  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  45.45 
 
 
121 aa  100  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2037  50S ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 
125 aa  100  9e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0646478  normal  0.703058 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  45.45 
 
 
121 aa  99.8  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  51.2 
 
 
125 aa  98.6  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  43.9 
 
 
121 aa  98.2  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  47.54 
 
 
126 aa  97.4  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0509  50S ribosomal protein L7/L12  53.6 
 
 
125 aa  97.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17495  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  54.1 
 
 
127 aa  97.1  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  48 
 
 
125 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  51.61 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4532  50S ribosomal protein L7/L12  52.38 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  48.8 
 
 
129 aa  95.5  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2263  50S ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 
124 aa  94.4  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3593  50S ribosomal protein L7/L12  52.85 
 
 
123 aa  94.4  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100169  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4443  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 
125 aa  94.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 
128 aa  94  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  50.4 
 
 
125 aa  94  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  54.62 
 
 
119 aa  94  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  53.39 
 
 
123 aa  94  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  54.1 
 
 
128 aa  94  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  50.41 
 
 
123 aa  93.6  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3247  50S ribosomal protein L7/L12  50.79 
 
 
126 aa  93.6  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3868  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 
124 aa  93.6  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3886  ribosomal protein L7/L12  50.41 
 
 
121 aa  93.6  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.449029  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  50.78 
 
 
128 aa  93.6  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0480  ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3690  50S ribosomal protein L7/L12  56.52 
 
 
120 aa  93.2  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100711  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  56.2 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  56.2 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  49.58 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3641  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.180921 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  51.22 
 
 
125 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  42.74 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  52 
 
 
125 aa  92  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5087  50S ribosomal protein L7/L12  44.63 
 
 
121 aa  92  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167617  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  42.74 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  41.32 
 
 
121 aa  92  2e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3898  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
126 aa  92  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  54.03 
 
 
124 aa  92  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  50.4 
 
 
125 aa  91.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  50.82 
 
 
126 aa  91.7  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  47.66 
 
 
128 aa  91.7  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0041  50S ribosomal protein L7/L12  49.6 
 
 
125 aa  91.3  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0709556  hitchhiker  0.00000000000056539 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  53.6 
 
 
129 aa  90.5  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0338  50S ribosomal protein L7/L12  48.72 
 
 
122 aa  90.1  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
124 aa  90.1  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3861  50S ribosomal protein L7/L12  48.72 
 
 
122 aa  90.1  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000856877  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2197  50S ribosomal protein L7/L12  47.97 
 
 
122 aa  90.1  9e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000379347  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0446  50S ribosomal protein L7/L12  44.63 
 
 
121 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690504  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2107  50S ribosomal protein L7/L12  47.97 
 
 
122 aa  90.1  9e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000324258  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0476  50S ribosomal protein L7/L12  44.63 
 
 
121 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0479  50S ribosomal protein L7/L12  44.63 
 
 
121 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00592833  hitchhiker  0.00479203 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0209  ribosomal protein L7/L12  50.41 
 
 
121 aa  90.1  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000161356  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  54.24 
 
 
124 aa  90.1  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4757  50S ribosomal protein L7/L12  44.63 
 
 
121 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0149649  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4484  50S ribosomal protein L7/L12  49.59 
 
 
121 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000110879 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  45.08 
 
 
125 aa  89.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4481  50S ribosomal protein L7/L12  49.59 
 
 
121 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102709 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4362  50S ribosomal protein L7/L12  49.59 
 
 
121 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.993642  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4394  50S ribosomal protein L7/L12  49.59 
 
 
121 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000226611  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4558  50S ribosomal protein L7/L12  49.59 
 
 
121 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.347891  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0204  ribosomal protein L7/L12  50.41 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002172  LSU ribosomal protein L7/L12 (L23e)  51.64 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000104246  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  54.24 
 
 
124 aa  90.1  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4698  50S ribosomal protein L7/L12  48.36 
 
 
122 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000163845  hitchhiker  0.00000529046 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  49.59 
 
 
126 aa  89  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  45.24 
 
 
126 aa  88.6  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  47.97 
 
 
128 aa  89.4  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  53.33 
 
 
126 aa  89.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00226  50S ribosomal protein L7/L12  50.82 
 
 
122 aa  89.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0587  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 
125 aa  89.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03862  50S ribosomal protein L7/L12  49.59 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000247439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4009  ribosomal protein L7/L12  49.59 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000814927  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4474  50S ribosomal protein L7/L12  49.59 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000613838  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5451  50S ribosomal protein L7/L12  49.59 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000730473  hitchhiker  0.0030051 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2177  ribosomal protein L7/L12  46.03 
 
 
126 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.866659 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  52.07 
 
 
122 aa  88.2  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  48.76 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4039  50S ribosomal protein L7/L12  49.59 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00670642  hitchhiker  0.000881188 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4434  50S ribosomal protein L7/L12  49.59 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00187873  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3452  50S ribosomal protein L7/L12  53.6 
 
 
125 aa  88.6  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175537  normal  0.439399 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4219  50S ribosomal protein L7/L12  49.59 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137425  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0196  50S ribosomal protein L7/L12  49.59 
 
 
121 aa  88.6  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000850088  normal  0.220465 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03815  hypothetical protein  49.59 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000273173  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4527  50S ribosomal protein L7/L12  49.59 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000174413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>