More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6958 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
267 aa  529  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.52 
 
 
248 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.59 
 
 
246 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.58 
 
 
246 aa  199  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 
255 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.746696  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 
246 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  0.189586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 
246 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.772329 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
246 aa  169  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00117266  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.54 
 
 
254 aa  162  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
254 aa  159  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
248 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.057049  hitchhiker  0.000702749 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000395  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  38.58 
 
 
252 aa  153  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.36672  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.3 
 
 
253 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1193  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.83 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.3 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 
270 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 
250 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 
251 aa  141  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.59 
 
 
253 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.37 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.749829  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 
256 aa  139  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
250 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.3 
 
 
267 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958829  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.72 
 
 
277 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  hitchhiker  0.00410102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.83 
 
 
244 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 
268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.1 
 
 
293 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
248 aa  135  5e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
258 aa  135  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 
268 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000210403  hitchhiker  0.00391645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0137  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0620  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.822121  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281584  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
268 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572934  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0588  short chain dehydrogenase  36.94 
 
 
260 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194347  normal  0.0391008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
252 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.64 
 
 
248 aa  131  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.08 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117153  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3549  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  37.98 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.93 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575966  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  35.53 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3702  short chain dehydrogenase  36.19 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.709318  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  36.23 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.94 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21038  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.59 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.08 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.1 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742124  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.54 
 
 
254 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.23 
 
 
250 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553116  normal  0.644711 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  35.88 
 
 
269 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.89 
 
 
278 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.88 
 
 
247 aa  129  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
250 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.165554 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.21 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566144  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0298  sorbitol dehydrogenase  33.21 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514875  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.82 
 
 
246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.6 
 
 
239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
254 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4672  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.69 
 
 
253 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572467  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2468  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
254 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72840  putative short-chain dehydrogenase  35.23 
 
 
252 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6322  putative short-chain dehydrogenase  35.23 
 
 
252 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1904  short chain dehydrogenase  35.61 
 
 
276 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.19258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877905  normal  0.0437007 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.83 
 
 
254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12763  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.5 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.382037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271838  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0639  putative dehydrogenase  40 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234435  normal  0.0579456 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.93 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.44826  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2992  short chain dehydrogenase  35.88 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  35.79 
 
 
257 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
257 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3499  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 
249 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.330671  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5467  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 
253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
249 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0144582 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
284 aa  125  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.757824  normal  0.126466 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  34.34 
 
 
269 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 
259 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
246 aa  125  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 
259 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 
259 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>