More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1791 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1791  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  416  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06590  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  35.19 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.52 
 
 		 214 aa  111  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3068  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.65 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.44153  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3794  two component LuxR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4108  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.39 
 
 		 210 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0581  two component LuxR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0922  two component LuxR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  26.6 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2180  two component LuxR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 216 aa  105  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973321  normal  0.0605156 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  26.11 
 
 		 214 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  26.11 
 
 		 214 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  26.11 
 
 		 214 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 214 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 239 aa  105  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  26.11 
 
 		 214 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  26.11 
 
 		 214 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  26.11 
 
 		 214 aa  105  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.06 
 
 		 210 aa  104  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0881  two component LuxR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 214 aa  104  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1873  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1895  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.75 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0032  two component LuxR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  27.09 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.53 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  25.62 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  26.11 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1595  two component LuxR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167261 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  28.08 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4250  two component LuxR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 246 aa  102  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.59923 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  27.09 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4382  two component LuxR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0651  two component LuxR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713834 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2253  response regulator  27.09 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000726498  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2052  response regulator  27.09 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000052182  hitchhiker  0.00148564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2356  response regulator  27.09 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.996954  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1594  response regulator  26.11 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  25.12 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1572  two component LuxR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.972408 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6196  two component LuxR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 215 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280791  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 210 aa  101  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  26.6 
 
 		 218 aa  101  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1119  two component LuxR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  25.62 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0036  putative two-component response regulator  33.18 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.035019  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00430  putative two-component response regulator  33.18 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.247974 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.08 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2669  response regulator  26.11 
 
 		 218 aa  99.8  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  28.43 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1216  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2237  two component LuxR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3494  two component LuxR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 226 aa  99.8  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5903  two component LuxR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68975  normal  0.398777 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0563  two component LuxR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  25.62 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  26.11 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1846  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.9 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349565  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  28.08 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3595  two component LuxR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.09 
 
 		 215 aa  98.6  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3242  two component LuxR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 213 aa  98.6  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000371761  hitchhiker  0.000468813 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  24.63 
 
 		 229 aa  98.2  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2086  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.85 
 
 		 220 aa  98.2  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  26.11 
 
 		 214 aa  98.2  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.64 
 
 		 210 aa  97.8  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  26.11 
 
 		 227 aa  97.8  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  27.59 
 
 		 215 aa  98.2  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 215 aa  98.2  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  27.59 
 
 		 215 aa  98.2  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  27.59 
 
 		 215 aa  98.2  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2202  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.64 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1725  LuxR family DNA-binding response regulator  27.09 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.08 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1228  LuxR family DNA-binding response regulator  27.09 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0904383  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0703  LuxR family DNA-binding response regulator  27.09 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.533722  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1518  response regulator  26.83 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.16 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1154  LuxR family DNA-binding response regulator  27.09 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>