58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0553 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0553  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 306 aa  580  1e-164  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.853568 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1757  Flp pilus assembly protein CpaB  31.4 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.336594  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  30.58 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  31.71 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  29.26 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  30.14 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  29.39 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  30.32 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  29.57 
 
 		 249 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1130  SAF domain protein  32.11 
 
 		 280 aa  52.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0558  putative Flp pilus assembly protein CpaB  36.79 
 
 		 274 aa  52.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  27.96 
 
 		 269 aa  52.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  34.59 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1910  putative Flp pilus assembly protein CpaB  36.79 
 
 		 274 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  28.95 
 
 		 261 aa  50.4  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  32.58 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  36.84 
 
 		 342 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  30.81 
 
 		 267 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  36.84 
 
 		 342 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0706  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  22.54 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3996  pilus assembly protein cpaB  31.34 
 
 		 270 aa  49.3  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  28.96 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  28.7 
 
 		 283 aa  49.3  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  28.64 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4475  Flp pilus assembly protein CpaB  34.26 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5126  SAF domain-containing protein  29.06 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0309  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  34.91 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  27.23 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  27.94 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  29.46 
 
 		 269 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  36.52 
 
 		 345 aa  46.2  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  29.73 
 
 		 305 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  35.09 
 
 		 278 aa  46.2  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0998  Flp pilus assembly CpaB  24.22 
 
 		 274 aa  46.2  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.82555 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  23.87 
 
 		 272 aa  45.8  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  30.35 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  30.35 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  30.35 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  23.83 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  29.35 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  31.25 
 
 		 275 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  28.64 
 
 		 265 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0245  SAF domain-containing protein  23.63 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1672  Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  35.26 
 
 		 189 aa  43.5  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  27.14 
 
 		 265 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  22.93 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  27.64 
 
 		 292 aa  43.1  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  29.35 
 
 		 279 aa  43.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2692  Flp pilus assembly protein CpaB  29.05 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000594167  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  26.35 
 
 		 271 aa  42.7  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2460  CpaB family Flp pilus assembly protein  32.46 
 
 		 345 aa  42.7  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0968707  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  27.18 
 
 		 279 aa  42.7  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1884  putative pilus assembly protein CpaB  31.9 
 
 		 350 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1681  Flp pilus assembly protein CpaB  31.9 
 
 		 350 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0337  Flp pilus assembly CpaB  31.9 
 
 		 350 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.720767  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1872  putative pilus assembly protein CpaB  31.9 
 
 		 350 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2039  CpaB family Flp pilus assembly protein  31.9 
 
 		 350 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0824  Flp pilus assembly protein CpaB  31.9 
 
 		 350 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.570609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>