More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1534 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01300  DNA-binding transcriptional dual regulator, tyrosine-binding  99.61 
 
 		 513 aa  1053    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0041974  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1649  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  91.81 
 
 		 513 aa  964    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.727425  hitchhiker  0.000895346 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2323  transcriptional regulator, TyrR  99.61 
 
 		 513 aa  1053    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00133165  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2302  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  99.61 
 
 		 513 aa  1053    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0336241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2152  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  86.16 
 
 		 514 aa  929    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1556  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  99.61 
 
 		 513 aa  1053    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01311  hypothetical protein  99.61 
 
 		 513 aa  1053    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00331968  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1902  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  70.6 
 
 		 525 aa  754    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1808  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  92.01 
 
 		 513 aa  966    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.354235 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1761  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  65.83 
 
 		 536 aa  703    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2324  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  68.09 
 
 		 522 aa  707    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1438  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  99.61 
 
 		 513 aa  1053    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2529  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  70.41 
 
 		 525 aa  751    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1968  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  99.42 
 
 		 513 aa  1051    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.337458 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1807  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  92.01 
 
 		 513 aa  966    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010497 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1869  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  92.01 
 
 		 513 aa  966    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.148583 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1467  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  92.01 
 
 		 513 aa  966    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0744789  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2617  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  73.09 
 
 		 523 aa  796    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.881496 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2604  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  67.7 
 
 		 522 aa  702    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1534  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  100 
 
 		 513 aa  1057    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1794  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  70.6 
 
 		 525 aa  754    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1799  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  99.61 
 
 		 513 aa  1053    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.322981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1729  DNA-binding transcriptional regulator TyrR  67.69 
 
 		 522 aa  722    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.52273  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0926  transcriptional regulator TyrR  52.04 
 
 		 513 aa  536  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01919  hypothetical protein  50.87 
 
 		 514 aa  521  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0864  transcriptional regulator, sigma-54 interaction protein  49.03 
 
 		 515 aa  516  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003165  transcriptional repressor protein TyrR  49.51 
 
 		 514 aa  512  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2998  transcriptional regulator, TyrR  49.71 
 
 		 518 aa  503  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.014514  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1717  transcriptional regulator, TyrR  49.61 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0924864  normal  0.0289301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2928  transcriptional regulator, TyrR  49.22 
 
 		 512 aa  500  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.422498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2220  transcriptional regulatory protein TyrR  48.44 
 
 		 512 aa  498  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02829  Transcriptional regulatory protein tyrR  47.47 
 
 		 518 aa  496  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0448077  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1669  transcriptional regulatory protein TyrR  49.32 
 
 		 512 aa  495  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2605  transcriptional regulator, TyrR  49.51 
 
 		 512 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  decreased coverage  0.000000106827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2672  transcriptional regulator, TyrR  49.51 
 
 		 512 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0181063  hitchhiker  0.0037784 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2779  transcriptional regulator, TyrR  49.32 
 
 		 512 aa  496  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00129727  hitchhiker  0.0000313655 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1388  transcriptional regulator, TyrR  48.05 
 
 		 512 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1517  transcriptional regulator, TyrR  48.05 
 
 		 512 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1481  transcriptional regulator, TyrR  48.05 
 
 		 512 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000204273  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2866  transcriptional regulator, TyrR  48.05 
 
 		 512 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313712  hitchhiker  0.0000000000767573 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1486  transcriptional regulator, TyrR  48.05 
 
 		 512 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.181258  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1330  transcriptional regulator, TyrR  47.47 
 
 		 512 aa  490  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540713  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1437  transcriptional regulator, TyrR  49.13 
 
 		 514 aa  490  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.555586  normal  0.67019 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2593  sigma-54 factor, interaction region  47.96 
 
 		 512 aa  482  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000497691  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1450  transcriptional regulator, TyrR  47.18 
 
 		 513 aa  476  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276382  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3764  sigma-54 dependent transcriptional regulator TyrR  43.08 
 
 		 516 aa  449  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.286891  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3111  transcriptional regulator, TyrR  46.54 
 
 		 517 aa  451  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605009 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1500  transcriptional regulator TyrR  45.7 
 
 		 520 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4489  transcriptional regulator TyrR  45.21 
 
 		 519 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1425  transcriptional regulator, TyrR  45.21 
 
 		 519 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.392472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3994  transcriptional regulator, TyrR  44.83 
 
 		 519 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.295924  normal  0.0800973 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3778  transcriptional regulator, TyrR  45.89 
 
 		 519 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18738  hitchhiker  0.000851143 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52980  transcriptional regulator PhhR  45.4 
 
 		 519 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4643  transcriptional regulator PhhR  45.75 
 
 		 515 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1823  phenylalanine hydroxylase transcriptional activator PhhR  44.08 
 
 		 521 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3574  helix-turn-helix, Fis-type  43.49 
 
 		 525 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4390  transcriptional regulator TyrR  41.78 
 
 		 502 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0997  sigma-54 dependent transcriptional regulator/sensory box protein  41.39 
 
 		 502 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1034  transcriptional regulator, TyrR  41.39 
 
 		 502 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4227  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  41.51 
 
 		 531 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0941591  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1280  transcriptional regulator TyrR, putative  40.99 
 
 		 502 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1101  helix-turn-helix, Fis-type  41.18 
 
 		 502 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0996  putative PAS/PAC sensor protein  41.44 
 
 		 502 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25940  sigma54-dependent activator protein  41.23 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.935166  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1348  putative PAS/PAC sensor protein  41.31 
 
 		 506 aa  354  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32940  transcriptional regulator  40.57 
 
 		 511 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000186487 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2801  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 511 aa  352  7e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3097  putative PAS/PAC sensor protein  40.53 
 
 		 510 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1706  sigma-54 dependent transcriptional regulator  34.44 
 
 		 532 aa  316  6e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1103  transcriptional regulatory protein  49.51 
 
 		 313 aa  295  1e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0663  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 527 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0090  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.74 
 
 		 541 aa  281  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00173924  hitchhiker  0.00306857 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1326  putative sigma54 specific transcriptional regulator  32.77 
 
 		 540 aa  279  9e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101296  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1758  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  31.73 
 
 		 498 aa  256  8e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001184  putative two-component response regulator  44.13 
 
 		 443 aa  251  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2382  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  31.69 
 
 		 539 aa  251  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0222564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1552  Fis family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 525 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.246478  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04971  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  42.86 
 
 		 444 aa  243  6e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1486  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.2 
 
 		 525 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0842644  hitchhiker  0.0000000147012 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2181  putative sigma54 specific transcriptional regulator  49.79 
 
 		 594 aa  237  4e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000200827 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2153  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  32.29 
 
 		 604 aa  236  7e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0725  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.47 
 
 		 636 aa  236  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0512499  normal  0.510149 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1719  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  31.52 
 
 		 582 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2640  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.65 
 
 		 532 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.56 
 
 		 470 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1825  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  42.95 
 
 		 336 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.760782  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4389  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 495 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205713  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1461  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.84 
 
 		 459 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.402822  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0608  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  40.95 
 
 		 527 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000979337 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0508  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  42.36 
 
 		 495 aa  231  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1635  Fis family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 576 aa  231  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.980236  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2132  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  42.31 
 
 		 336 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.11031  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4088  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  42.68 
 
 		 457 aa  230  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.0065577  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4456  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.68 
 
 		 457 aa  230  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.764911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0372  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  41.36 
 
 		 461 aa  230  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3407  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.32 
 
 		 458 aa  229  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1219  NifA subfamily transcriptional regulator  40.32 
 
 		 529 aa  229  8e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.832328  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1743  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  42.59 
 
 		 336 aa  229  9e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0362051  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0516  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39 
 
 		 468 aa  228  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000971097  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1319  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.95 
 
 		 452 aa  228  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>