145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1952 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1952  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
543 aa  1103    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0380  glycosyl transferase family protein  48.99 
 
 
538 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.885586 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0337  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.33 
 
 
560 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.285985  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0105  glycosyl transferase family protein  42.77 
 
 
637 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2395  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.22 
 
 
562 aa  183  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3144  glycosyl transferase family 2  36.07 
 
 
565 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0908  glycosyl transferase family protein  39.43 
 
 
574 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0909  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
545 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0792484  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0215  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.83 
 
 
582 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1487  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.64 
 
 
543 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00150044  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1927  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 
643 aa  156  8e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1486  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.07 
 
 
644 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0093458  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3143  glycosyl transferase family 2  37.83 
 
 
599 aa  154  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2686  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 
643 aa  150  6e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.137899 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 
1523 aa  73.6  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 
1523 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
279 aa  69.3  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  26.29 
 
 
1644 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  26.29 
 
 
1644 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
1739 aa  64.3  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  26.71 
 
 
616 aa  63.9  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
290 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
455 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  27.7 
 
 
291 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  25.53 
 
 
337 aa  58.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  25.34 
 
 
705 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  24.64 
 
 
283 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  25.61 
 
 
291 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2885  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
345 aa  57.4  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.37137  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
336 aa  57.4  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 
337 aa  57  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  22.73 
 
 
294 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  22.67 
 
 
1162 aa  56.6  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  26.25 
 
 
330 aa  56.2  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
334 aa  56.2  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  24.43 
 
 
994 aa  55.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  23.97 
 
 
282 aa  55.1  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  24.29 
 
 
785 aa  54.3  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  23.14 
 
 
369 aa  54.3  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 
619 aa  53.9  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  24.72 
 
 
1340 aa  52.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3594  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
290 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
333 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 
430 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
691 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
725 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
924 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
742 aa  52  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  20.46 
 
 
401 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 
691 aa  52  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  28.72 
 
 
742 aa  52  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 
691 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0069  glycosyl transferase family 2  33.8 
 
 
302 aa  50.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.866174  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  23.24 
 
 
958 aa  50.8  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
345 aa  50.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 
683 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  24.74 
 
 
298 aa  50.4  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  24 
 
 
321 aa  50.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 
307 aa  50.4  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
1268 aa  50.4  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  24.42 
 
 
1106 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  24.48 
 
 
317 aa  49.7  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 
339 aa  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 
415 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  23.5 
 
 
1267 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
742 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  26.78 
 
 
988 aa  50.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  25 
 
 
358 aa  49.3  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.67 
 
 
427 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4538  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 
319 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3825  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 
319 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
729 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  22.53 
 
 
624 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3699  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 
319 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  25.49 
 
 
340 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  25.96 
 
 
318 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  23.44 
 
 
330 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  25.99 
 
 
725 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5551  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
319 aa  48.9  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.63 
 
 
317 aa  48.5  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 
311 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 
318 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3728  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
319 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703441  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  23.21 
 
 
1435 aa  48.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
822 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2494  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
322 aa  47.8  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0194335  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 
880 aa  47.8  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 
318 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 
721 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  24.35 
 
 
286 aa  47.8  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  20.13 
 
 
703 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 
332 aa  47.8  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 
318 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1617  family 2 glycosyl transferase  28.63 
 
 
292 aa  47.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  21.51 
 
 
320 aa  47.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
314 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 
318 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
318 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  22.16 
 
 
722 aa  47  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
303 aa  47.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>