53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1486 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1486  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
644 aa  1325    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0093458  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3143  glycosyl transferase family 2  40.07 
 
 
599 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0908  glycosyl transferase family protein  40.14 
 
 
574 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0909  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
545 aa  196  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0792484  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0215  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.38 
 
 
582 aa  177  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2686  glycosyl transferase family protein  30.55 
 
 
643 aa  171  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.137899 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3144  glycosyl transferase family 2  35.96 
 
 
565 aa  170  9e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1927  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 
643 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0337  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.67 
 
 
560 aa  162  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.285985  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1487  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.29 
 
 
543 aa  162  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00150044  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2395  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.22 
 
 
562 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1952  glycosyl transferase family 2  32.8 
 
 
543 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0105  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 
637 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0380  glycosyl transferase family protein  34 
 
 
538 aa  150  5e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.885586 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  25.79 
 
 
785 aa  66.6  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  24.53 
 
 
430 aa  61.2  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.23 
 
 
427 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  23.92 
 
 
291 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  24 
 
 
624 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  22.68 
 
 
880 aa  55.5  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  23.9 
 
 
679 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  23.73 
 
 
754 aa  55.1  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 
279 aa  55.1  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  22.4 
 
 
291 aa  54.3  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  22.22 
 
 
330 aa  54.3  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  24.17 
 
 
270 aa  53.9  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 
301 aa  52.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  24.62 
 
 
1267 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  21.21 
 
 
321 aa  50.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  24.01 
 
 
1644 aa  50.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  24.01 
 
 
1644 aa  50.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  24.1 
 
 
683 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  27.16 
 
 
742 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  25.75 
 
 
415 aa  50.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  25.29 
 
 
616 aa  50.4  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  21.53 
 
 
1162 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  22 
 
 
1435 aa  48.9  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  21.59 
 
 
298 aa  48.5  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
983 aa  48.1  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  25.95 
 
 
280 aa  47.4  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  21.83 
 
 
283 aa  46.6  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  25.34 
 
 
717 aa  47.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 
617 aa  46.2  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  25.86 
 
 
742 aa  45.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  23.33 
 
 
1340 aa  45.4  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  25.67 
 
 
717 aa  45.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  24.5 
 
 
311 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  22.13 
 
 
336 aa  45.8  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  21.71 
 
 
282 aa  44.3  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
742 aa  44.3  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
331 aa  44.3  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
286 aa  43.9  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  21.6 
 
 
996 aa  44.3  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>