158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0908 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0908  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
574 aa  1142    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3143  glycosyl transferase family 2  53.46 
 
 
599 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1486  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.14 
 
 
644 aa  364  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0093458  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0909  glycosyl transferase family protein  41.27 
 
 
545 aa  217  5e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0792484  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3144  glycosyl transferase family 2  33.21 
 
 
565 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1952  glycosyl transferase family 2  39.43 
 
 
543 aa  187  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0337  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.55 
 
 
560 aa  187  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.285985  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1487  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.39 
 
 
543 aa  186  9e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00150044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0105  glycosyl transferase family protein  37.43 
 
 
637 aa  183  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2686  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
643 aa  183  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.137899 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0215  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.55 
 
 
582 aa  176  9e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1927  glycosyl transferase family 2  36.55 
 
 
643 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2395  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.47 
 
 
562 aa  169  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0380  glycosyl transferase family protein  38.64 
 
 
538 aa  157  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.885586 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 
616 aa  85.1  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 
1523 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
1523 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  27.24 
 
 
1162 aa  71.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
785 aa  71.2  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  24.21 
 
 
1435 aa  66.6  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 
624 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 
1267 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
430 aa  64.3  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
337 aa  64.3  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  27 
 
 
427 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  26.49 
 
 
1267 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  25.56 
 
 
279 aa  62.4  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
619 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  23.48 
 
 
679 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  26.78 
 
 
286 aa  59.7  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  22.9 
 
 
369 aa  58.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 
1268 aa  58.5  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  27.09 
 
 
717 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 
340 aa  57.4  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 
1152 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  27.57 
 
 
291 aa  57  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  33.33 
 
 
567 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 
299 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
415 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0186  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
348 aa  55.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  25.56 
 
 
754 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 
710 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
1297 aa  55.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  30.37 
 
 
575 aa  54.7  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  26.67 
 
 
632 aa  54.7  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
575 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 
455 aa  54.3  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
691 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  24.04 
 
 
270 aa  54.3  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  25.88 
 
 
280 aa  54.3  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  29.3 
 
 
1837 aa  53.9  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  25.39 
 
 
311 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2262  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 
411 aa  53.9  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0285994  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 
298 aa  53.9  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  25.28 
 
 
525 aa  53.5  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
332 aa  53.5  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.27 
 
 
309 aa  53.5  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
334 aa  53.5  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
725 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
683 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 
691 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  25.5 
 
 
311 aa  52.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0269  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 
346 aa  52.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
310 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3347  glycosyl transferase family protein  23.9 
 
 
308 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  24.51 
 
 
2401 aa  52  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  26.59 
 
 
324 aa  52  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 
584 aa  52  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
311 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 
308 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 
324 aa  52  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  25.83 
 
 
291 aa  52  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
325 aa  51.6  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
717 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 
337 aa  51.6  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  25.88 
 
 
320 aa  51.2  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
573 aa  51.2  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0123  glycosyl transferase family 2  24.6 
 
 
480 aa  51.2  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000103201  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  25.91 
 
 
330 aa  51.2  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
329 aa  51.2  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
573 aa  51.2  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
457 aa  51.2  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  26.69 
 
 
700 aa  50.8  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 
334 aa  50.8  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
312 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  24.63 
 
 
318 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 
306 aa  50.4  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 
996 aa  50.4  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
841 aa  50.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  28.25 
 
 
348 aa  50.4  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 
593 aa  50.4  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  25.29 
 
 
725 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.12 
 
 
254 aa  50.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
568 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  23.99 
 
 
341 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  25.27 
 
 
318 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 
891 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 
318 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  25.8 
 
 
691 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  33.59 
 
 
1340 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>