63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0337 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0337  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
560 aa  1152    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.285985  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0105  glycosyl transferase family protein  50.09 
 
 
637 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2395  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.81 
 
 
562 aa  483  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1952  glycosyl transferase family 2  43.33 
 
 
543 aa  221  3e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0380  glycosyl transferase family protein  39.94 
 
 
538 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.885586 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3144  glycosyl transferase family 2  35.33 
 
 
565 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0908  glycosyl transferase family protein  37.58 
 
 
574 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0909  glycosyl transferase family protein  36.75 
 
 
545 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0792484  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0215  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.51 
 
 
582 aa  164  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1486  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.67 
 
 
644 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0093458  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3143  glycosyl transferase family 2  36.86 
 
 
599 aa  160  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1487  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.13 
 
 
543 aa  147  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00150044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2686  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
643 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.137899 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1927  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
643 aa  137  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  26.3 
 
 
1523 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 
1523 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2264  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 
270 aa  65.1  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  25.29 
 
 
311 aa  62.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  26.18 
 
 
1077 aa  56.6  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  24.51 
 
 
1644 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  24.51 
 
 
1644 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  25.43 
 
 
291 aa  55.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 
298 aa  55.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  25.33 
 
 
392 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  23.04 
 
 
320 aa  52  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
415 aa  51.6  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  26.21 
 
 
700 aa  50.8  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
430 aa  50.4  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  24.14 
 
 
1152 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 
336 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
1162 aa  49.7  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  23.6 
 
 
369 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  24.23 
 
 
1435 aa  49.3  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  22.04 
 
 
1267 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  22.66 
 
 
286 aa  48.5  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2253  glycosyl transferase family 2  23.79 
 
 
331 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.628199  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2191  glycosyl transferase family 2  23.79 
 
 
331 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  22.52 
 
 
291 aa  47.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  21.12 
 
 
283 aa  47.8  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  22.27 
 
 
1267 aa  47.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  24.68 
 
 
1075 aa  47  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  23.43 
 
 
882 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  27.63 
 
 
1119 aa  47  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  23.73 
 
 
1268 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  23.87 
 
 
279 aa  47  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5651  glycosyl transferase family protein  23.33 
 
 
315 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  21.71 
 
 
339 aa  45.8  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
313 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  21.43 
 
 
303 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0893  glycosyl transferase family 2  26.23 
 
 
337 aa  45.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2201  putative signal peptide protein  23.51 
 
 
286 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 
297 aa  45.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2183  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 
995 aa  45.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
318 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2262  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 
411 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0285994  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0513  glycosyl transferase family protein  22.9 
 
 
355 aa  44.7  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.149546  normal  0.0426124 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 
318 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01954  hypothetical protein  27.08 
 
 
279 aa  43.9  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  22.03 
 
 
331 aa  43.9  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01965  predicted glycosyl transferase  27.08 
 
 
279 aa  43.9  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 
299 aa  43.9  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  20.8 
 
 
824 aa  43.9  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  23.48 
 
 
1106 aa  43.9  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>