More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0909 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0909  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
545 aa  1094    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0792484  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3144  glycosyl transferase family 2  59.21 
 
 
565 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1487  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.07 
 
 
543 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00150044  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1927  glycosyl transferase family 2  39.42 
 
 
643 aa  340  4e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2686  glycosyl transferase family protein  39.83 
 
 
643 aa  330  3e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.137899 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0215  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.3 
 
 
582 aa  291  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0908  glycosyl transferase family protein  40.52 
 
 
574 aa  218  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1486  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.9 
 
 
644 aa  207  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0093458  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3143  glycosyl transferase family 2  32.59 
 
 
599 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1952  glycosyl transferase family 2  38.62 
 
 
543 aa  189  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0105  glycosyl transferase family protein  35.69 
 
 
637 aa  187  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0337  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.85 
 
 
560 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.285985  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2395  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.24 
 
 
562 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0380  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 
538 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.885586 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 
1435 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  24.48 
 
 
1523 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  21.97 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 
616 aa  64.3  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  23.4 
 
 
1523 aa  64.3  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
299 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 
298 aa  62.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
291 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  25.78 
 
 
2401 aa  61.6  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  26.38 
 
 
785 aa  61.6  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
336 aa  60.1  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  25.49 
 
 
337 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2514  hypothetical protein  26.5 
 
 
1074 aa  58.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  24.09 
 
 
320 aa  58.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
326 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  24.33 
 
 
311 aa  57  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  22.37 
 
 
455 aa  57  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  23.64 
 
 
300 aa  56.6  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  33 
 
 
332 aa  56.6  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 
1077 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
1268 aa  56.6  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0460  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
1045 aa  55.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0791075  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  23.75 
 
 
624 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.58 
 
 
327 aa  54.7  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.58 
 
 
327 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  25.58 
 
 
327 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  25.58 
 
 
327 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  23.05 
 
 
322 aa  54.7  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 
282 aa  53.9  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3219  glycosyl transferase family 2  34.68 
 
 
314 aa  54.3  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 
272 aa  53.9  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 
300 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 
342 aa  53.5  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  30.69 
 
 
300 aa  53.5  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
329 aa  53.5  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3244  glycosyl transferase family 2  37.63 
 
 
398 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 
327 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0425  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.63 
 
 
398 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0385  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.63 
 
 
398 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  25.86 
 
 
283 aa  53.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  27.06 
 
 
279 aa  53.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
308 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.81 
 
 
327 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3265  glycosyl transferase family protein  37.63 
 
 
398 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 
1739 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0391  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.63 
 
 
398 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.105387  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2551  glycosyl transferase family protein  36 
 
 
476 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  27.85 
 
 
291 aa  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.81 
 
 
327 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 
670 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
318 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 
345 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1210  glycosyl transferase family protein  36 
 
 
476 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.96364  normal  0.0584943 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
270 aa  52  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
617 aa  52  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3730  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
336 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.202885 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  22.66 
 
 
339 aa  51.6  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
313 aa  51.6  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  26.56 
 
 
1837 aa  51.6  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  25.3 
 
 
334 aa  51.6  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
331 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2749  glycosyl transferase family protein  36.08 
 
 
288 aa  51.6  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 
322 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
310 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
310 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  23.85 
 
 
339 aa  51.2  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 
316 aa  51.2  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  24.27 
 
 
303 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
317 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1179  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
308 aa  51.2  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3764  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 
1137 aa  50.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
319 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
309 aa  50.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2693  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 
325 aa  50.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1166  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.45 
 
 
297 aa  50.4  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 
430 aa  50.4  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
328 aa  50.4  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
318 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
528 aa  50.4  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2088  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.27 
 
 
384 aa  50.4  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  21.98 
 
 
401 aa  50.4  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
324 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  27.46 
 
 
318 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  34.17 
 
 
344 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 
1267 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 
358 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>