142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0380 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0380  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
538 aa  1091    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.885586 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1952  glycosyl transferase family 2  48.99 
 
 
543 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0337  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.94 
 
 
560 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.285985  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0105  glycosyl transferase family protein  40.95 
 
 
637 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2395  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.85 
 
 
562 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3144  glycosyl transferase family 2  37.38 
 
 
565 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1487  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.88 
 
 
543 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00150044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0909  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 
545 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0792484  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0908  glycosyl transferase family protein  36.08 
 
 
574 aa  157  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1486  glycosyl transferase, group 2 family protein  34 
 
 
644 aa  150  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0093458  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1927  glycosyl transferase family 2  32.96 
 
 
643 aa  146  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0215  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.93 
 
 
582 aa  144  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3143  glycosyl transferase family 2  34.7 
 
 
599 aa  130  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2686  glycosyl transferase family protein  31.61 
 
 
643 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.137899 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
279 aa  70.1  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
336 aa  69.3  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  26.32 
 
 
283 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 
994 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  25.39 
 
 
785 aa  61.2  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  25.42 
 
 
1644 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  25.42 
 
 
1644 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
318 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
1523 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  24.07 
 
 
401 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 
299 aa  57.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  26.38 
 
 
1523 aa  57.4  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  26.2 
 
 
318 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  22.05 
 
 
369 aa  56.6  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  26.78 
 
 
291 aa  55.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 
318 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 
318 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 
341 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  23.75 
 
 
1435 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  26.16 
 
 
330 aa  55.1  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  23.25 
 
 
345 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
298 aa  54.3  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  19.18 
 
 
860 aa  54.3  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 
320 aa  54.3  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  23.71 
 
 
337 aa  53.9  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  19.84 
 
 
294 aa  53.5  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  27.53 
 
 
334 aa  53.5  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 
290 aa  53.5  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  21.27 
 
 
902 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 
359 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
339 aa  52.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  34.11 
 
 
314 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0885  glycosyl transferase family 2  23.45 
 
 
817 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 
282 aa  52.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
313 aa  51.6  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 
335 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  23.23 
 
 
765 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  22.89 
 
 
958 aa  51.6  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
1106 aa  51.2  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.24 
 
 
427 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
597 aa  51.2  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 
312 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  22.76 
 
 
1077 aa  50.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 
662 aa  51.2  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  24.39 
 
 
337 aa  50.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 
313 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 
313 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 
455 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
313 aa  50.8  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  21.51 
 
 
624 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2352  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
317 aa  50.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
330 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  25 
 
 
700 aa  50.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1570  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  29.17 
 
 
498 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.892629  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  23.4 
 
 
1739 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 
312 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  24.3 
 
 
329 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7608  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
1299 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  24.07 
 
 
1162 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
330 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  25.52 
 
 
1119 aa  48.5  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
310 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 
1268 aa  48.5  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  23.98 
 
 
286 aa  48.5  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  29.03 
 
 
1041 aa  48.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 
358 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 
691 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  36.46 
 
 
390 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  20.3 
 
 
832 aa  47.8  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 
318 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 
619 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 
334 aa  47.4  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3347  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 
308 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  34.02 
 
 
311 aa  47.4  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.81 
 
 
266 aa  47  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.81 
 
 
266 aa  47  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  28.81 
 
 
266 aa  47  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 
327 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 
345 aa  47  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.81 
 
 
266 aa  47  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
311 aa  47  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2494  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 
322 aa  46.6  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0194335  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  23.84 
 
 
748 aa  47  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  24.78 
 
 
291 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  24.16 
 
 
754 aa  46.6  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  21.98 
 
 
924 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>