38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0105 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2395  glycosyl transferase, group 2 family protein  67.74 
 
 		 562 aa  734    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0105  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 637 aa  1290    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0337  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.09 
 
 		 560 aa  503  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.285985  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1952  glycosyl transferase family 2  42.77 
 
 		 543 aa  208  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0380  glycosyl transferase family protein  40.95 
 
 		 538 aa  208  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.885586 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3144  glycosyl transferase family 2  36.17 
 
 		 565 aa  189  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0909  glycosyl transferase family protein  37.3 
 
 		 545 aa  181  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0792484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0908  glycosyl transferase family protein  36.8 
 
 		 574 aa  177  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0214685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1486  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.88 
 
 		 644 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0093458  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2686  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 		 643 aa  151  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.137899 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3143  glycosyl transferase family 2  37.41 
 
 		 599 aa  150  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0215  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.55 
 
 		 582 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1487  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.4 
 
 		 543 aa  146  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00150044  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1927  glycosyl transferase family 2  29.59 
 
 		 643 aa  140  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  27.08 
 
 		 1644 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  27.08 
 
 		 1644 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  24.48 
 
 		 1267 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  25.75 
 
 		 279 aa  53.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1960  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 		 326 aa  50.8  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.581867  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  22.78 
 
 		 339 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  22.8 
 
 		 311 aa  49.3  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  22.78 
 
 		 1077 aa  48.5  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 		 1267 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  24.14 
 
 		 320 aa  48.1  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  25 
 
 		 291 aa  47.8  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 		 312 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  24.38 
 
 		 1523 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  24.61 
 
 		 299 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  22.66 
 
 		 283 aa  46.2  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2264  glycosyl transferase family 2  26.25 
 
 		 270 aa  45.8  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  21.9 
 
 		 624 aa  45.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 		 298 aa  44.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  25.39 
 
 		 338 aa  44.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2562  succinoglycan biosynthesis protein exoM  25.78 
 
 		 326 aa  44.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  24.49 
 
 		 1523 aa  43.9  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0069  glycosyl transferase family 2  33.67 
 
 		 302 aa  43.9  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.866174  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  26.76 
 
 		 1119 aa  43.9  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02810  predicted glycosyltransferase  28.87 
 
 		 323 aa  43.9  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>