67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1927 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1927  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
643 aa  1271    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2686  glycosyl transferase family protein  53.43 
 
 
643 aa  580  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.137899 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0215  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.46 
 
 
582 aa  497  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1487  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.92 
 
 
543 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00150044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0909  glycosyl transferase family protein  38.62 
 
 
545 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0792484  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3144  glycosyl transferase family 2  36.69 
 
 
565 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0908  glycosyl transferase family protein  35.79 
 
 
574 aa  169  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1486  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.54 
 
 
644 aa  163  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0093458  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1952  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 
543 aa  156  9e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3143  glycosyl transferase family 2  35.31 
 
 
599 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0380  glycosyl transferase family protein  32.96 
 
 
538 aa  146  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.885586 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0105  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
637 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0337  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 
560 aa  137  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.285985  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2395  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.7 
 
 
562 aa  132  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  26.92 
 
 
283 aa  60.5  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 
282 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
332 aa  53.5  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08980  glycosyl transferase  43.53 
 
 
329 aa  52.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 
358 aa  52  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0926  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 
310 aa  50.8  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 
748 aa  50.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
358 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2332  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
491 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  35.59 
 
 
313 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  35.59 
 
 
313 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
279 aa  48.9  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 
309 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
328 aa  48.9  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  31.11 
 
 
310 aa  48.5  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  22.6 
 
 
320 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 
528 aa  48.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0269  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
335 aa  48.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  27.81 
 
 
1119 aa  47.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
401 aa  47.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 
345 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  32.71 
 
 
310 aa  47.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2970  glycosyl transferase family 2  26.59 
 
 
322 aa  47.4  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3594  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
290 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
303 aa  47  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
310 aa  47  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 
350 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
584 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  36.08 
 
 
313 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0268  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
323 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
297 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  27.41 
 
 
1523 aa  45.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 
296 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2264  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 
270 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  28.1 
 
 
300 aa  45.8  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 
303 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  32.22 
 
 
313 aa  45.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1180  glycosyltransferase, group 2 family protein  26.23 
 
 
322 aa  45.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 
397 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5644  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
307 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223754  normal  0.273017 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6392  glycosyl transferase family protein  37.3 
 
 
307 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863517  normal  0.0945582 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  30.23 
 
 
281 aa  45.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  35.65 
 
 
344 aa  44.7  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  35.65 
 
 
344 aa  44.7  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  27.12 
 
 
338 aa  44.3  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
296 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4948  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 
342 aa  44.3  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.217559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  26.89 
 
 
1157 aa  44.3  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
291 aa  44.3  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2753  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 
310 aa  43.9  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  25.37 
 
 
339 aa  43.9  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
338 aa  43.9  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  30.63 
 
 
340 aa  43.9  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>