124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3143 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_3143  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
599 aa  1187    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0908  glycosyl transferase family protein  53.92 
 
 
574 aa  534  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1486  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.7 
 
 
644 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0093458  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0909  glycosyl transferase family protein  33.16 
 
 
545 aa  203  7e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0792484  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0215  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.15 
 
 
582 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3144  glycosyl transferase family 2  35.55 
 
 
565 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1927  glycosyl transferase family 2  36.53 
 
 
643 aa  167  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1952  glycosyl transferase family 2  37.79 
 
 
543 aa  167  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0337  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.25 
 
 
560 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.285985  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2686  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
643 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.137899 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0105  glycosyl transferase family protein  37.67 
 
 
637 aa  158  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1487  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.08 
 
 
543 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00150044  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2395  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.64 
 
 
562 aa  151  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0380  glycosyl transferase family protein  34.94 
 
 
538 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.885586 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 
616 aa  70.5  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
679 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 
299 aa  70.1  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
624 aa  67.8  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  24.19 
 
 
1075 aa  67.4  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  24.64 
 
 
1162 aa  66.2  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  23.47 
 
 
1523 aa  65.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 
1267 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  23.95 
 
 
1523 aa  64.3  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
270 aa  62.4  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  24.05 
 
 
785 aa  63.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 
298 aa  60.5  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  24.71 
 
 
291 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 
310 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
311 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
742 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
725 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 
742 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
732 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
742 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  21.61 
 
 
455 aa  58.2  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  20.3 
 
 
369 aa  55.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  27.34 
 
 
555 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 
725 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
324 aa  54.7  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  24.51 
 
 
336 aa  54.7  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
1340 aa  54.3  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  24.64 
 
 
1077 aa  53.9  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
332 aa  54.3  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 
299 aa  53.9  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  25.96 
 
 
305 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 
683 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  27.09 
 
 
691 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 
430 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  24.58 
 
 
2401 aa  52  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  25.39 
 
 
415 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  24.5 
 
 
397 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2262  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 
411 aa  52  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0285994  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  24.09 
 
 
1267 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  18.39 
 
 
457 aa  51.6  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 
691 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  25.87 
 
 
551 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
710 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0069  glycosyl transferase family 2  26.28 
 
 
302 aa  50.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.866174  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  23.89 
 
 
322 aa  50.8  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 
324 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  23.83 
 
 
1739 aa  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  23.9 
 
 
1435 aa  50.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  24.17 
 
 
279 aa  50.4  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  24.34 
 
 
717 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  19.15 
 
 
320 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 
328 aa  49.7  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  23.51 
 
 
341 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  24.07 
 
 
337 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  24.67 
 
 
311 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2807  glycosyl transferase family protein  21.43 
 
 
419 aa  49.3  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  25.67 
 
 
551 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2528  glycosyl transferase family 2  23.74 
 
 
307 aa  48.9  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.591132  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 
705 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  21.05 
 
 
1268 aa  48.9  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  22.87 
 
 
754 aa  48.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 
300 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  24.14 
 
 
958 aa  48.5  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2183  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 
995 aa  47.8  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 
331 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  24.47 
 
 
342 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3730  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
336 aa  47.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.202885 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 
305 aa  47.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  24.39 
 
 
325 aa  47.4  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
303 aa  47.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  24.34 
 
 
717 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  24.72 
 
 
775 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0186  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
348 aa  47.4  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 
617 aa  47  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
308 aa  47  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0657  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 
307 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  25.61 
 
 
283 aa  47  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.62 
 
 
427 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
312 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  24.28 
 
 
729 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
568 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  27.33 
 
 
691 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  21.22 
 
 
291 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
320 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 
680 aa  46.2  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 
983 aa  46.2  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>