99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3144 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_3144  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
565 aa  1123    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0909  glycosyl transferase family protein  59.21 
 
 
545 aa  597  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0792484  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1487  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.08 
 
 
543 aa  472  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00150044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2686  glycosyl transferase family protein  40.6 
 
 
643 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.137899 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1927  glycosyl transferase family 2  37.3 
 
 
643 aa  325  1e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0215  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.88 
 
 
582 aa  303  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0105  glycosyl transferase family protein  36.97 
 
 
637 aa  200  7e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0908  glycosyl transferase family protein  38.58 
 
 
574 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0337  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.33 
 
 
560 aa  192  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.285985  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1952  glycosyl transferase family 2  36.07 
 
 
543 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0380  glycosyl transferase family protein  36.65 
 
 
538 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.885586 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2395  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.99 
 
 
562 aa  174  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1486  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.96 
 
 
644 aa  170  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0093458  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3143  glycosyl transferase family 2  36.03 
 
 
599 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 
1523 aa  60.8  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 
298 aa  57.4  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  24.39 
 
 
337 aa  57  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  25.18 
 
 
624 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  24.45 
 
 
339 aa  55.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  23.33 
 
 
1523 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2514  hypothetical protein  25.79 
 
 
1074 aa  55.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
334 aa  55.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  22.3 
 
 
297 aa  55.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  23.35 
 
 
339 aa  53.9  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
307 aa  53.9  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
326 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 
330 aa  51.6  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
318 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  23.46 
 
 
320 aa  51.2  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 
1152 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  32.46 
 
 
1169 aa  50.8  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0460  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 
1045 aa  50.4  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0791075  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
332 aa  50.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  24.21 
 
 
785 aa  49.7  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1847  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
1116 aa  49.3  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.944284  normal  0.0115409 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  28.5 
 
 
318 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30 
 
 
326 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  25.98 
 
 
1077 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  25.18 
 
 
1739 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  27.43 
 
 
340 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
318 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  24.18 
 
 
616 aa  49.3  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
318 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
1035 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  19.38 
 
 
320 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
336 aa  48.9  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 
290 aa  48.9  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
319 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
358 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  33.87 
 
 
344 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 
313 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  24.32 
 
 
1837 aa  47.8  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  32.48 
 
 
340 aa  47.8  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  23.38 
 
 
679 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 
742 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 
334 aa  47.4  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 
308 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 
311 aa  47.4  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 
373 aa  47  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 
347 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  22.27 
 
 
283 aa  46.6  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
305 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  20.4 
 
 
1152 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
705 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  32.35 
 
 
616 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  20.4 
 
 
1152 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 
617 aa  47  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  24.83 
 
 
299 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0431  putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC  33.62 
 
 
1636 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.89 
 
 
326 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
725 aa  45.8  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 
1268 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
725 aa  45.8  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 
732 aa  46.2  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
294 aa  45.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.78 
 
 
326 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  24.05 
 
 
958 aa  45.4  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  24.34 
 
 
279 aa  45.4  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  20.57 
 
 
1435 aa  45.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 
294 aa  45.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1383  glycosyltransferase-like protein  28.04 
 
 
954 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  20.93 
 
 
455 aa  45.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  23.53 
 
 
272 aa  44.7  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
294 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 
350 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  34.07 
 
 
584 aa  45.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  24.66 
 
 
397 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  21.86 
 
 
401 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.84 
 
 
312 aa  44.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
331 aa  44.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
310 aa  44.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  25.45 
 
 
700 aa  44.3  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
317 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  35.34 
 
 
300 aa  44.3  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  22.71 
 
 
1162 aa  44.3  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 
544 aa  43.9  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
379 aa  43.5  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  23.08 
 
 
860 aa  43.9  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  31 
 
 
1168 aa  43.5  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>