More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0207 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0207  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 		 429 aa  865    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0605362 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1663  thiamine biosynthesis protein ThiC  80.42 
 
 		 429 aa  676    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.275056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1680  thiamine biosynthesis protein ThiC  73.43 
 
 		 429 aa  615  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0628  thiamine biosynthesis protein ThiC  69.19 
 
 		 426 aa  597  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2427  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.57 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2910  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.95 
 
 		 436 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2890  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.84 
 
 		 432 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000275023  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3463  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.57 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2596  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.99 
 
 		 432 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.545863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2236  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.24 
 
 		 430 aa  365  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0145  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.73 
 
 		 434 aa  365  1e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3852  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.01 
 
 		 435 aa  364  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0141  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.31 
 
 		 424 aa  364  2e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0604  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.24 
 
 		 436 aa  363  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0139  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.07 
 
 		 424 aa  363  3e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1421  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.8 
 
 		 425 aa  363  3e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.99 
 
 		 468 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2518  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.85 
 
 		 432 aa  362  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453923  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.61 
 
 		 463 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3529  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.19 
 
 		 437 aa  360  3e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0373  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.47 
 
 		 420 aa  360  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000321341  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.61 
 
 		 463 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.61 
 
 		 463 aa  359  6e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_681  thiamine biosynthesis protein  48.29 
 
 		 431 aa  359  6e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.383158  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2776  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.12 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00094064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2045  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.48 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2764  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.76 
 
 		 429 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458002  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.12 
 
 		 453 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0701  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.7 
 
 		 431 aa  355  7.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1596  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.33 
 
 		 432 aa  352  5e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0775  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.52 
 
 		 431 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1401  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.84 
 
 		 432 aa  351  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0974  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.24 
 
 		 432 aa  352  1e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893445  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.06 
 
 		 453 aa  350  2e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0670  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.61 
 
 		 436 aa  350  3e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0668  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.61 
 
 		 436 aa  349  5e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.59 
 
 		 473 aa  349  5e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0367  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.24 
 
 		 436 aa  348  9e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2018  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.52 
 
 		 432 aa  345  8e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1359  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.44 
 
 		 428 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.046519  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1114  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.31 
 
 		 431 aa  344  2e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000374822  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.94 
 
 		 450 aa  343  2.9999999999999997e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1489  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.97 
 
 		 426 aa  338  9e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0765  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.73 
 
 		 426 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0965  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.01 
 
 		 606 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.831801  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1186  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.49 
 
 		 426 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.618429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1597  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.8 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1173  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.78 
 
 		 427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1592  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.95 
 
 		 425 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000634578  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1189  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.25 
 
 		 426 aa  336  5e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0104  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.77 
 
 		 426 aa  335  7e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.64083  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3677  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.96 
 
 		 436 aa  335  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.286824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2297  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.9 
 
 		 475 aa  334  2e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0471  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.96 
 
 		 435 aa  333  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5222  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.75 
 
 		 567 aa  333  5e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2129  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.09 
 
 		 428 aa  332  9e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.09 
 
 		 489 aa  332  9e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0543  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.45 
 
 		 442 aa  332  9e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.762964 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0602  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.71 
 
 		 432 aa  331  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0787  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.63 
 
 		 425 aa  331  2e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.346957  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.2 
 
 		 481 aa  330  3e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0053  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.68 
 
 		 426 aa  330  3e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1722  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.74 
 
 		 426 aa  330  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00870726  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0315  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.09 
 
 		 426 aa  330  4e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.326801  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1468  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.13 
 
 		 431 aa  329  6e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000710454  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.18 
 
 		 460 aa  329  7e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.18 
 
 		 460 aa  329  7e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0703  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.15 
 
 		 429 aa  328  8e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.18 
 
 		 459 aa  328  9e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1684  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.93 
 
 		 431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000247869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0063  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.09 
 
 		 614 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2593  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.53 
 
 		 503 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.93 
 
 		 457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4274  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.84 
 
 		 530 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662161  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3206  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.81 
 
 		 627 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1742  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.57 
 
 		 617 aa  327  3e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.89 
 
 		 458 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0906  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.79 
 
 		 435 aa  326  5e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.598412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4530  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.07 
 
 		 627 aa  325  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0391297  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2653  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.51 
 
 		 573 aa  324  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34570  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.76 
 
 		 548 aa  323  3e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3883  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.89 
 
 		 530 aa  323  3e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0892  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.61 
 
 		 885 aa  323  4e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.33 
 
 		 460 aa  323  4e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0650  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.23 
 
 		 568 aa  322  5e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1249  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3185  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.35 
 
 		 628 aa  322  6e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0350436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1891  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.57 
 
 		 630 aa  322  7e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0976553  normal  0.536126 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1610  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.57 
 
 		 630 aa  322  7e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0307755  normal  0.0806317 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3893  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.69 
 
 		 435 aa  322  8e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.377066 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.94 
 
 		 457 aa  322  8e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3005  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.75 
 
 		 435 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1523  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.79 
 
 		 631 aa  321  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.428931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.85 
 
 		 456 aa  321  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3809  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.69 
 
 		 435 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2999  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.57 
 
 		 609 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3703  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.94 
 
 		 564 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0278  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.04 
 
 		 565 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.84 
 
 		 466 aa  320  3e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1629  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.08 
 
 		 630 aa  320  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.984407  normal  0.732533 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0798  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.95 
 
 		 554 aa  319  5e-86  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>