More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1813 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4667  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  74.21 
 
 
508 aa  766    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.815165 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5325  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  74.4 
 
 
509 aa  758    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000685886  normal  0.0298656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3257  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  86.59 
 
 
507 aa  927    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0650  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  72.58 
 
 
515 aa  759    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.280918  normal  0.338117 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3532  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  82.05 
 
 
507 aa  852    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4531  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  74.21 
 
 
508 aa  764    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00489729  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3423  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.82 
 
 
500 aa  638    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2604  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  90.73 
 
 
507 aa  929    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.723331 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4088  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.98 
 
 
515 aa  753    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0782  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  70.36 
 
 
508 aa  741    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5128  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.08 
 
 
509 aa  752    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.565819 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4047  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.06 
 
 
508 aa  760    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0193592  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1559  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  81.45 
 
 
500 aa  833    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4961  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  74.4 
 
 
509 aa  758    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3949  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.26 
 
 
508 aa  762    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0301  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.83 
 
 
495 aa  739    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0689  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  69.09 
 
 
508 aa  736    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0900  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  73.43 
 
 
494 aa  731    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5648  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.13 
 
 
503 aa  741    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3975  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.98 
 
 
515 aa  753    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4258  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  71.79 
 
 
507 aa  749    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.969937  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4902  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.79 
 
 
509 aa  769    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00679319  normal  0.0803346 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2180  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.37 
 
 
1119 aa  749    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01703  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  81.38 
 
 
494 aa  814    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995864  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10720  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  79.44 
 
 
501 aa  798    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.593646  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0695  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.47 
 
 
508 aa  754    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0219  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  83.17 
 
 
501 aa  850    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0716  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  73.99 
 
 
504 aa  768    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2033  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  71.06 
 
 
508 aa  763    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127043  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0828  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.22 
 
 
509 aa  745    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520502  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3695  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  92.7 
 
 
507 aa  953    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.220047  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4665  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.82 
 
 
508 aa  761    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0943847  normal  0.197111 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2009  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  98.42 
 
 
507 aa  1028    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.123027 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1801  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.02 
 
 
509 aa  745    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4542  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.46 
 
 
508 aa  755    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.91832  normal  0.896051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3478  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.26 
 
 
508 aa  762    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3576  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.94 
 
 
524 aa  761    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1086  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.54 
 
 
503 aa  746    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0995729  decreased coverage  0.00377502 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0244  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.93 
 
 
508 aa  741    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1517  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.43 
 
 
494 aa  730    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3406  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  74.55 
 
 
549 aa  756    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.58505  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0920  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.22 
 
 
533 aa  746    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4319  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.06 
 
 
508 aa  760    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.778752  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3658  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  74.19 
 
 
509 aa  755    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1813  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
507 aa  1038    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0767  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  75.3 
 
 
508 aa  765    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.40455 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3442  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.06 
 
 
508 aa  759    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0115375 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4383  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.99 
 
 
509 aa  770    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0339576 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2133  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.1 
 
 
497 aa  598  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0948  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.5 
 
 
496 aa  599  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0854951  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4773  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.68 
 
 
502 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05483  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.37 
 
 
497 aa  588  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54620  aldehyde dehydrogenase  57.49 
 
 
502 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325197 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000374  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.82 
 
 
497 aa  582  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1574  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.67 
 
 
497 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001546  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.09 
 
 
497 aa  584  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1377  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  57.58 
 
 
498 aa  581  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.282571 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3201  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.55 
 
 
501 aa  580  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.55227  hitchhiker  0.000671545 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18120  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.67 
 
 
497 aa  581  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.921037  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1376  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.48 
 
 
497 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0294673  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2782  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.77 
 
 
499 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1668  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.14 
 
 
501 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0813192  hitchhiker  0.00645867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1474  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.11 
 
 
501 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00459347 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1942  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.67 
 
 
501 aa  568  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1339  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.67 
 
 
497 aa  567  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2770  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  56.77 
 
 
499 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2596  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  56.36 
 
 
499 aa  558  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000530409 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1678  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.36 
 
 
499 aa  558  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2855  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.76 
 
 
499 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000577054 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2663  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  56.16 
 
 
499 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.775906  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1398  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.76 
 
 
499 aa  553  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1526  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.56 
 
 
499 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1496  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.76 
 
 
499 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1490  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.76 
 
 
499 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03591  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12870)  52.95 
 
 
536 aa  521  1e-146  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_23467  dehydrogenase methylmalonate-semialdhyde dehydrogenase  55.22 
 
 
537 aa  518  1e-146  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01990  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase, putative  53.77 
 
 
552 aa  493  9.999999999999999e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2245  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  52.18 
 
 
500 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.230017  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02860  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase (acylating)  51.22 
 
 
508 aa  491  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02030  Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], putative  53.54 
 
 
531 aa  481  1e-135  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.227536  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2159  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  49.6 
 
 
510 aa  483  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.360109 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1351  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  49.37 
 
 
506 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.241244  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2559  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  50.83 
 
 
497 aa  481  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3940  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  49.6 
 
 
498 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.90589  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1312  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  49.37 
 
 
506 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.648779  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80168  mitochondrial aldehyde dehydrogenase  49.19 
 
 
543 aa  482  1e-135  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0419  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  50.84 
 
 
498 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214339  hitchhiker  0.00208567 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0386  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  50.63 
 
 
498 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433719  normal  0.0679471 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0741  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  51.11 
 
 
506 aa  481  1e-134  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.888468  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1410  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  48.95 
 
 
506 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0206  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  49.06 
 
 
497 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515725  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1702  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  52.18 
 
 
500 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0228992  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1446  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  50.84 
 
 
507 aa  479  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494247  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2117  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  49.19 
 
 
498 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1432  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  48.95 
 
 
506 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1035  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  48.95 
 
 
506 aa  475  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0950  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  48.95 
 
 
506 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0618  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
499 aa  475  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01600  putative aldehyde dehydrogenase  48.75 
 
 
497 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510904  normal  0.728588 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0420  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  50.32 
 
 
499 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>