More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1574 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1376  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.84 
 
 
497 aa  770    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0294673  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1678  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.15 
 
 
499 aa  762    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1377  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  70.73 
 
 
498 aa  724    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.282571 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1526  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.95 
 
 
499 aa  759    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001546  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  68.01 
 
 
497 aa  722    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2782  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  70.14 
 
 
499 aa  754    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1574  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
497 aa  1022    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1668  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.18 
 
 
501 aa  770    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0813192  hitchhiker  0.00645867 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05483  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67.61 
 
 
497 aa  721    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1496  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.15 
 
 
499 aa  759    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1942  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.81 
 
 
501 aa  769    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1398  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.35 
 
 
499 aa  762    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2133  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.06 
 
 
497 aa  751    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0948  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  68.78 
 
 
496 aa  723    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0854951  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2596  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  72.95 
 
 
499 aa  759    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000530409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4773  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  68.33 
 
 
502 aa  725    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2663  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  72.75 
 
 
499 aa  758    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.775906  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1474  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.49 
 
 
501 aa  746    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00459347 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1339  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.83 
 
 
497 aa  770    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2855  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.35 
 
 
499 aa  764    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000577054 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1490  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.35 
 
 
499 aa  763    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18120  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  98.59 
 
 
497 aa  1011    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.921037  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54620  aldehyde dehydrogenase  68.33 
 
 
502 aa  724    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325197 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000374  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  68.35 
 
 
497 aa  724    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3201  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  69.26 
 
 
501 aa  749    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.55227  hitchhiker  0.000671545 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2770  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  73.15 
 
 
499 aa  761    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0695  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.11 
 
 
508 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3658  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.62 
 
 
509 aa  600  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0716  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  57.49 
 
 
504 aa  598  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4902  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.4 
 
 
509 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00679319  normal  0.0803346 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4383  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.2 
 
 
509 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0339576 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5325  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.81 
 
 
509 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000685886  normal  0.0298656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4667  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.1 
 
 
508 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.815165 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3949  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.39 
 
 
508 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3478  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.8 
 
 
508 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110303 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0767  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.1 
 
 
508 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.40455 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3406  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.81 
 
 
549 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.58505  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4531  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.1 
 
 
508 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00489729  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4665  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.1 
 
 
508 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0943847  normal  0.197111 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4961  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.81 
 
 
509 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0920  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.42 
 
 
533 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2033  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  55.98 
 
 
508 aa  589  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127043  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1801  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.7 
 
 
509 aa  591  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0828  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.42 
 
 
509 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520502  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4319  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.59 
 
 
508 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.778752  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3442  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.19 
 
 
508 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0115375 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4047  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.59 
 
 
508 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0193592  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0900  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  57.98 
 
 
494 aa  585  1e-166  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4258  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  56.94 
 
 
507 aa  587  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.969937  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2180  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.42 
 
 
1119 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0301  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.18 
 
 
495 aa  585  1e-166  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1517  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.18 
 
 
494 aa  586  1e-166  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0650  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  57.49 
 
 
515 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.280918  normal  0.338117 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0782  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.88 
 
 
508 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0689  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.29 
 
 
508 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3975  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.77 
 
 
515 aa  578  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4088  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.77 
 
 
515 aa  578  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0244  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.81 
 
 
508 aa  579  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5128  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.88 
 
 
509 aa  579  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.565819 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1086  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.09 
 
 
503 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0995729  decreased coverage  0.00377502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3257  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.26 
 
 
507 aa  574  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3576  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.06 
 
 
524 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5648  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.88 
 
 
503 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4542  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  54.77 
 
 
508 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.91832  normal  0.896051 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1813  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.67 
 
 
507 aa  567  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0219  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.48 
 
 
501 aa  565  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2009  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  54.66 
 
 
507 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.123027 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3695  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.47 
 
 
507 aa  563  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.220047  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2604  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  54.66 
 
 
507 aa  552  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.723331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3532  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.26 
 
 
507 aa  553  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10720  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.63 
 
 
501 aa  552  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.593646  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01703  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.21 
 
 
494 aa  551  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995864  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1559  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  53.16 
 
 
500 aa  538  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3423  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  52.63 
 
 
500 aa  530  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3670  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  51.55 
 
 
502 aa  507  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0597  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  50.4 
 
 
497 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0775  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  50.2 
 
 
497 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00425927  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0637  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  50.4 
 
 
497 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000149078  normal  0.27415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01600  putative aldehyde dehydrogenase  50 
 
 
497 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510904  normal  0.728588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4566  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  50.4 
 
 
497 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000243063  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0642  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  50.4 
 
 
497 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000457228  decreased coverage  0.0000167809 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_23467  dehydrogenase methylmalonate-semialdhyde dehydrogenase  51.05 
 
 
537 aa  501  1e-140  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0679  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
497 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000513111  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0206  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  49.39 
 
 
497 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515725  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0836  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  51.36 
 
 
498 aa  497  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1432  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  49.59 
 
 
498 aa  491  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1597  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  47.78 
 
 
506 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0687  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  52.06 
 
 
500 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0098  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  48.98 
 
 
498 aa  489  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1791  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  50.1 
 
 
508 aa  488  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0686  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  49.19 
 
 
497 aa  491  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000335425  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02860  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase (acylating)  51.35 
 
 
508 aa  489  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1446  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  49.07 
 
 
507 aa  490  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494247  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1444  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  50.72 
 
 
499 aa  489  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0424754  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4215  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  50.31 
 
 
499 aa  490  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1282  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  50.92 
 
 
499 aa  491  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24316  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0249  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  50.52 
 
 
505 aa  488  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0386  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  50.1 
 
 
498 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433719  normal  0.0679471 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2245  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  56 
 
 
500 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.230017  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00766  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  48.17 
 
 
496 aa  486  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>