More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1282 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02392  transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  66.26 
 
 		 499 aa  639    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3524  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  67.41 
 
 		 506 aa  654    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.132108  normal  0.367269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1282  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 499 aa  1012    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4215  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  94.59 
 
 		 499 aa  942    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3107  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  65.05 
 
 		 496 aa  665    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.281488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4274  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.25 
 
 		 507 aa  648    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.463031  normal  0.914985 
 
 
-
 
NC_004310  BR1832  methylmalonic acid semialdehyde dehydrogenase  61.57 
 
 		 498 aa  648    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.800551  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0386  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.59 
 
 		 498 aa  685    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433719  normal  0.0679471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0775  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.41 
 
 		 497 aa  640    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00425927  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1791  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  80.96 
 
 		 508 aa  827    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5814  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66 
 
 		 507 aa  656    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5010  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.66 
 
 		 506 aa  640    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3343  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.95 
 
 		 503 aa  635    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1185  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.92 
 
 		 496 aa  680    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.773308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0836  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.1 
 
 		 498 aa  662    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3801  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.53 
 
 		 511 aa  643    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.228893  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1113  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.19 
 
 		 496 aa  676    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000656277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3021  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  69.42 
 
 		 497 aa  655    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.13552  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1765  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase (acylating)  61.37 
 
 		 498 aa  648    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0679  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.21 
 
 		 497 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000513111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2416  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67.61 
 
 		 497 aa  706    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1446  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62 
 
 		 507 aa  659    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2521  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  85.77 
 
 		 499 aa  862    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1083  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.92 
 
 		 496 aa  674    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000148294  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0249  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  65.93 
 
 		 505 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2399  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.68 
 
 		 502 aa  649    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169024  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5828  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  63.71 
 
 		 535 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4384  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.25 
 
 		 507 aa  648    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.640119 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1351  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.52 
 
 		 506 aa  658    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.241244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0686  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.01 
 
 		 497 aa  636    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000335425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4746  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  62.96 
 
 		 505 aa  637    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4576  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.71 
 
 		 506 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3003  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.94 
 
 		 503 aa  634    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3917  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.45 
 
 		 512 aa  640    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1091  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.12 
 
 		 496 aa  680    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00014498  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3271  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.41 
 
 		 502 aa  640    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190179  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4812  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.11 
 
 		 506 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2071  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  65.11 
 
 		 501 aa  648    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1138  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  89.78 
 
 		 499 aa  889    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3333  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.79 
 
 		 508 aa  636    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1151  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.92 
 
 		 496 aa  677    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2117  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.97 
 
 		 498 aa  653    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1068  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.17 
 
 		 498 aa  648    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0980  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.41 
 
 		 512 aa  653    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2368  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.84 
 
 		 504 aa  651    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3095  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.77 
 
 		 498 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.769898  normal  0.126836 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0419  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.58 
 
 		 498 aa  679    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214339  hitchhiker  0.00208567 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0015  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.31 
 
 		 512 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2650  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.47 
 
 		 496 aa  687    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000962307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2023  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.2 
 
 		 507 aa  657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.794475  normal  0.0299094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3694  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  62.1 
 
 		 498 aa  650    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3302  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.17 
 
 		 537 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0935  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.6 
 
 		 501 aa  673    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0357372  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2175  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.59 
 
 		 500 aa  660    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210117  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1597  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.73 
 
 		 506 aa  655    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3248  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  83.33 
 
 		 509 aa  828    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0324  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.3 
 
 		 498 aa  645    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.948085  normal  0.128274 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0950  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.11 
 
 		 506 aa  659    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3822  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  65.18 
 
 		 506 aa  655    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3204  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.72 
 
 		 496 aa  679    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.887195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4703  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.12 
 
 		 501 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000699732  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0965  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.8 
 
 		 496 aa  680    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0738299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3319  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  62.98 
 
 		 498 aa  664    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1043  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.79 
 
 		 496 aa  677    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0205992  normal  0.342071 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1444  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  99.8 
 
 		 499 aa  1010    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0424754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2928  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  65.45 
 
 		 496 aa  668    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0642  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.62 
 
 		 497 aa  635    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000457228  decreased coverage  0.0000167809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3010  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  65.25 
 
 		 496 aa  668    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.10059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1035  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.17 
 
 		 506 aa  653    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3023  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.53 
 
 		 499 aa  671    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0588426  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2193  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.91 
 
 		 498 aa  645    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.365355  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1312  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.91 
 
 		 506 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.648779  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5681  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.92 
 
 		 503 aa  640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1334  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.94 
 
 		 503 aa  635    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3940  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.27 
 
 		 498 aa  655    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.90589  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2475  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.19 
 
 		 498 aa  673    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55823  normal  0.220752 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0420  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  63.1 
 
 		 499 aa  652    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3578  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  63.18 
 
 		 498 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.605326 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2619  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.07 
 
 		 522 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719043  normal  0.528801 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1432  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.11 
 
 		 506 aa  659    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1410  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.52 
 
 		 506 aa  660    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0175  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  70.45 
 
 		 509 aa  704    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262954  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0597  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.62 
 
 		 497 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0206  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.01 
 
 		 497 aa  631  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515725  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2536  putative transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  64.31 
 
 		 504 aa  633  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10767  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase mmsA  60.78 
 
 		 510 aa  634  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0017569  normal  0.759995 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0637  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.62 
 
 		 497 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000149078  normal  0.27415 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3332  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.71 
 
 		 505 aa  632  1e-180  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4566  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.62 
 
 		 497 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000243063  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1432  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.01 
 
 		 498 aa  630  1e-179  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3379  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.79 
 
 		 540 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25753  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2931  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.79 
 
 		 508 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1877  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.15 
 
 		 508 aa  629  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719864 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0202  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.79 
 
 		 508 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2977  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.35 
 
 		 508 aa  630  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4070  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.79 
 
 		 508 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3049  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.02 
 
 		 508 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1611  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.79 
 
 		 508 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01600  putative aldehyde dehydrogenase  61.26 
 
 		 497 aa  631  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510904  normal  0.728588 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2990  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.79 
 
 		 540 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>