More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1086 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4667  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  83.4 
 
 
508 aa  860    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.815165 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0767  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  84.91 
 
 
508 aa  865    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.40455 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3532  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  70.66 
 
 
507 aa  736    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0650  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  86.67 
 
 
515 aa  899    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.280918  normal  0.338117 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3423  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.2 
 
 
500 aa  639    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0920  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  83.9 
 
 
533 aa  852    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0828  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  83.9 
 
 
509 aa  852    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520502  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0782  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  82.8 
 
 
508 aa  860    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3695  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.91 
 
 
507 aa  738    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.220047  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3658  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  84.31 
 
 
509 aa  856    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2604  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  73.31 
 
 
507 aa  746    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.723331 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5128  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  89.34 
 
 
509 aa  904    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.565819 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4542  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  82.73 
 
 
508 aa  845    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.91832  normal  0.896051 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2009  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  74.34 
 
 
507 aa  749    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.123027 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3975  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  85.24 
 
 
515 aa  905    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0689  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  82.8 
 
 
508 aa  858    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01703  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.08 
 
 
494 aa  735    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995864  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0900  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  68.56 
 
 
494 aa  699    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10720  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73 
 
 
501 aa  731    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.593646  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4258  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  82.93 
 
 
507 aa  858    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.969937  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2180  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  84.07 
 
 
1119 aa  855    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0695  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  84.1 
 
 
508 aa  872    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4665  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  83.6 
 
 
508 aa  863    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0943847  normal  0.197111 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4088  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  85.24 
 
 
515 aa  905    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0716  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  83.5 
 
 
504 aa  861    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2033  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  83.4 
 
 
508 aa  867    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127043  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4531  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  83.6 
 
 
508 aa  863    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00489729  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1801  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  84.71 
 
 
509 aa  858    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1813  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.54 
 
 
507 aa  746    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3257  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.44 
 
 
507 aa  768    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3576  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  88.05 
 
 
524 aa  930    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1086  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
503 aa  1029    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0995729  decreased coverage  0.00377502 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0244  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  94.81 
 
 
508 aa  953    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5325  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  83.9 
 
 
509 aa  853    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000685886  normal  0.0298656 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1517  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  68.56 
 
 
494 aa  699    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1559  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.86 
 
 
500 aa  738    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0219  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.4 
 
 
501 aa  747    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3406  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  83.9 
 
 
549 aa  852    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.58505  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4319  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  82.6 
 
 
508 aa  860    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.778752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4047  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  82.6 
 
 
508 aa  860    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0193592  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4961  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  83.9 
 
 
509 aa  853    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3478  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  83 
 
 
508 aa  863    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110303 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3949  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  82.4 
 
 
508 aa  861    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4902  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  82.09 
 
 
509 aa  856    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00679319  normal  0.0803346 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5648  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  96.62 
 
 
503 aa  979    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3442  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  82.4 
 
 
508 aa  862    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0115375 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4383  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  81.69 
 
 
509 aa  853    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0339576 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0301  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  69.37 
 
 
495 aa  706    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0948  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.7 
 
 
496 aa  619  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0854951  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2133  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.55 
 
 
497 aa  617  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1376  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.34 
 
 
497 aa  608  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0294673  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1942  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.4 
 
 
501 aa  609  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4773  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.38 
 
 
502 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05483  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.18 
 
 
497 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54620  aldehyde dehydrogenase  58.38 
 
 
502 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325197 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3201  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.54 
 
 
501 aa  598  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.55227  hitchhiker  0.000671545 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1339  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.94 
 
 
497 aa  598  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1668  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.34 
 
 
501 aa  595  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0813192  hitchhiker  0.00645867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1474  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.14 
 
 
501 aa  595  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00459347 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1678  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.58 
 
 
499 aa  591  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000374  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.81 
 
 
497 aa  594  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2782  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.16 
 
 
499 aa  593  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2770  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  57.58 
 
 
499 aa  592  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2596  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  57.58 
 
 
499 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000530409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18120  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.09 
 
 
497 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.921037  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1490  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.97 
 
 
499 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1574  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.09 
 
 
497 aa  591  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2855  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.97 
 
 
499 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000577054 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2663  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  57.37 
 
 
499 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.775906  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001546  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.06 
 
 
497 aa  587  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1398  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.17 
 
 
499 aa  588  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1377  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  56.16 
 
 
498 aa  588  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.282571 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1526  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.57 
 
 
499 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1496  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.55 
 
 
499 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03591  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12870)  53.62 
 
 
536 aa  528  1e-148  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_23467  dehydrogenase methylmalonate-semialdhyde dehydrogenase  52.95 
 
 
537 aa  523  1e-147  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2245  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  52.3 
 
 
500 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.230017  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1446  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  49.16 
 
 
507 aa  494  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494247  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4566  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  49.17 
 
 
497 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000243063  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01600  putative aldehyde dehydrogenase  48.96 
 
 
497 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510904  normal  0.728588 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0597  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  48.76 
 
 
497 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2159  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  49.9 
 
 
510 aa  488  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.360109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0686  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  48.34 
 
 
497 aa  490  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000335425  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0637  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  48.76 
 
 
497 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000149078  normal  0.27415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0642  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  48.76 
 
 
497 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000457228  decreased coverage  0.0000167809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0206  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  48.55 
 
 
497 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515725  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0420  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  50.74 
 
 
499 aa  489  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0679  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  48.13 
 
 
497 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000513111  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3302  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  47.38 
 
 
537 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0775  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  47.72 
 
 
497 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00425927  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0836  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  48.95 
 
 
498 aa  482  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2117  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  47.38 
 
 
498 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3940  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  47.18 
 
 
498 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.90589  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0015  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  47.9 
 
 
512 aa  481  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2559  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  48.96 
 
 
497 aa  482  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1702  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  51.88 
 
 
500 aa  481  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0228992  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0175  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  48.15 
 
 
509 aa  480  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262954  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1629  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  52.09 
 
 
500 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118006  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1351  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  47.92 
 
 
506 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.241244  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1312  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  47.71 
 
 
506 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.648779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>