More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0386 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_1080  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  67.4 
 
 
506 aa  699    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.141199 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3785  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  74.3 
 
 
498 aa  742    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.361497  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1832  methylmalonic acid semialdehyde dehydrogenase  73.69 
 
 
498 aa  767    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.800551  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2193  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.64 
 
 
498 aa  750    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.365355  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0386  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
498 aa  1023    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433719  normal  0.0679471 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4479  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.67 
 
 
499 aa  669    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1068  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  74.1 
 
 
498 aa  767    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1791  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.32 
 
 
508 aa  668    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1282  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.59 
 
 
499 aa  660    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24316  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1444  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.79 
 
 
499 aa  663    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0424754  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0324  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  86.75 
 
 
498 aa  890    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.948085  normal  0.128274 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2159  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.14 
 
 
510 aa  727    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.360109 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3070  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.48 
 
 
506 aa  695    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274558  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3940  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.69 
 
 
498 aa  781    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.90589  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2962  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  70.68 
 
 
499 aa  690    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.216142  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1138  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.23 
 
 
499 aa  645    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1765  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase (acylating)  73.9 
 
 
498 aa  768    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2071  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  68.36 
 
 
501 aa  696    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1446  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.29 
 
 
507 aa  747    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494247  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3902  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.35 
 
 
513 aa  672    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.560303  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01513  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase, putative  61.65 
 
 
499 aa  641    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2117  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.89 
 
 
498 aa  779    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0855  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  64.86 
 
 
498 aa  671    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.345114  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1913  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  72.75 
 
 
499 aa  723    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.815666  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02860  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase (acylating)  63.21 
 
 
508 aa  671    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3095  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.9 
 
 
498 aa  778    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.769898  normal  0.126836 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0618  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67.74 
 
 
499 aa  711    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2475  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.69 
 
 
498 aa  781    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55823  normal  0.220752 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5010  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  68.33 
 
 
506 aa  715    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3302  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.49 
 
 
537 aa  781    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3248  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.25 
 
 
509 aa  652    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2559  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.15 
 
 
497 aa  736    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2175  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  74.04 
 
 
500 aa  769    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210117  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0419  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  97.79 
 
 
498 aa  1006    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214339  hitchhiker  0.00208567 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1106  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  65.66 
 
 
499 aa  675    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3049  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.46 
 
 
497 aa  646    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.205238 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1747  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.14 
 
 
499 aa  712    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207366  normal  0.6572 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5017  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  65.06 
 
 
499 aa  674    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248363  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0652  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  65.26 
 
 
502 aa  667    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198803  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1064  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  67.4 
 
 
506 aa  699    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3319  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  74.5 
 
 
498 aa  794    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1409  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.05 
 
 
498 aa  649    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.671216  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2521  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.31 
 
 
499 aa  660    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2838  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  60.56 
 
 
499 aa  637    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.753586  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1609  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  70.68 
 
 
499 aa  691    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0517581 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1091  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  67.4 
 
 
506 aa  699    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0630  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.44 
 
 
499 aa  671    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1362  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  68.19 
 
 
534 aa  712    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0420  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  64.65 
 
 
499 aa  693    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3578  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  74.5 
 
 
498 aa  771    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.605326 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1389  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  69.68 
 
 
499 aa  700    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0836  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  86.95 
 
 
498 aa  912    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4215  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.05 
 
 
499 aa  668    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10767  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase mmsA  66.07 
 
 
510 aa  694    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0017569  normal  0.759995 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0965  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.44 
 
 
496 aa  633  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0738299  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2650  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.84 
 
 
496 aa  629  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000962307  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0935  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.85 
 
 
501 aa  622  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0357372  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1091  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.43 
 
 
496 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00014498  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1043  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.24 
 
 
496 aa  622  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0205992  normal  0.342071 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3204  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.83 
 
 
496 aa  621  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.887195  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1113  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.23 
 
 
496 aa  624  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000656277  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1083  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.43 
 
 
496 aa  622  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000148294  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1185  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.23 
 
 
496 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.773308  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1151  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.23 
 
 
496 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1597  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.08 
 
 
506 aa  621  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0175  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.31 
 
 
509 aa  616  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262954  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3010  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  57.43 
 
 
496 aa  615  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.10059  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2368  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.18 
 
 
504 aa  612  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2928  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  57.23 
 
 
496 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250419  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3023  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.29 
 
 
499 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0588426  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3107  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  57.23 
 
 
496 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.281488  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3271  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.8 
 
 
502 aa  607  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190179  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5814  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.43 
 
 
507 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3524  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  59.88 
 
 
506 aa  600  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.132108  normal  0.367269 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0249  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  59.48 
 
 
505 aa  599  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1035  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.46 
 
 
506 aa  601  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2023  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.83 
 
 
507 aa  597  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.794475  normal  0.0299094 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6743  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.36 
 
 
498 aa  594  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1432  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.11 
 
 
498 aa  593  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3021  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.64 
 
 
497 aa  593  1e-168  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.13552  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1351  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.25 
 
 
506 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.241244  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0775  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.22 
 
 
497 aa  588  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00425927  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3801  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.11 
 
 
511 aa  590  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.228893  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2416  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.14 
 
 
497 aa  591  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0679  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.22 
 
 
497 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000513111  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0980  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.06 
 
 
512 aa  588  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1312  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.25 
 
 
506 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.648779  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4384  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.78 
 
 
507 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.640119 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3694  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  55.94 
 
 
498 aa  585  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2977  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.03 
 
 
508 aa  585  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4274  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.78 
 
 
507 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.463031  normal  0.914985 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5681  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.46 
 
 
503 aa  584  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0950  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.65 
 
 
506 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1410  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.05 
 
 
506 aa  588  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1432  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.65 
 
 
506 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3917  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.35 
 
 
512 aa  587  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3049  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  54.83 
 
 
508 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1877  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  54.83 
 
 
508 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719864 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5828  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  57.26 
 
 
535 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0015  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.58 
 
 
512 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>