39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4292 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4292  CRISPR-associated protein Cas6  100 
 
 
244 aa  498  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160921  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3942  CRISPR-associated protein Cas6  52.46 
 
 
246 aa  286  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000148244  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0971  CRISPR-associated protein Cas6  38.33 
 
 
249 aa  182  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1817  CRISPR-associated Cas family protein  39.92 
 
 
264 aa  177  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.536762  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0535  CRISPR-associated Cas family protein  40.96 
 
 
252 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0625  CRISPR-associated protein Cas6  36.51 
 
 
256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0936  CRISPR-associated Cas family protein  36.78 
 
 
240 aa  158  7e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1676  CRISPR-associated Cas family protein  36.36 
 
 
243 aa  156  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.602428  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2303  CRISPR-associated Cas family protein  39 
 
 
240 aa  155  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1394  CRISPR-associated Cas family protein  34.65 
 
 
247 aa  151  8.999999999999999e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1884  CRISPR-associated Cas family protein  36.99 
 
 
248 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1190  CRISPR-associated protein Cas6  32.93 
 
 
248 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2327  CRISPR-associated Cas family protein  38.49 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0271  CRISPR-associated Cas6 family protein  33.6 
 
 
257 aa  142  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1768  CRISPR-associated Cas family protein  35.18 
 
 
261 aa  142  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2618  CRISPR-associated protein Cas6  32.67 
 
 
267 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.032021  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0467  CRISPR-associated protein Cas6  33.73 
 
 
250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0355  CRISPR-associated Cas family protein  32.03 
 
 
242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0312  CRISPR-associated protein Cas6  30.36 
 
 
249 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.196521  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1007  CRISPR-associated Cas family protein  30.04 
 
 
250 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000750551  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1099  CRISPR-associated Cas family protein  27.78 
 
 
250 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000187286  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2044  CRISPR-associated Cas family protein  29.06 
 
 
267 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0876015  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2448  CRISPR-associated protein Cas6  28.79 
 
 
264 aa  107  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.970754  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0524  CRISPR-associated protein Cas6  28.14 
 
 
265 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1170  CRISPR-associated Cas family protein  30.73 
 
 
210 aa  92.8  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0816614 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0438  CRISPR-associated protein Cas6  26.57 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3847  CRISPR-associated protein Cas6  27.34 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0301  CRISPR-associated Cas6 family protein  29.05 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0414334  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1121  CRISPR-associated Cas6 family protein  24.58 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0913  CRISPR-associated protein Cas6  25.88 
 
 
255 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000034525  unclonable  0.000000000117947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0932  CRISPR-associated protein Cas6  25.93 
 
 
229 aa  58.9  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2028  CRISPR-associated Cas family protein  24.07 
 
 
233 aa  48.9  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1005  CRISPR-associated Cas family protein  22.73 
 
 
230 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1224  CRISPR-associated protein Cas6  24.77 
 
 
252 aa  46.2  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1088  CRISPR-associated Cas family protein  25.27 
 
 
241 aa  46.2  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1593  CRISPR-associated protein Cas6  30.16 
 
 
242 aa  45.8  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.24413  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1021  CRISPR-associated protein Cas6  27.23 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000207098  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2218  hypothetical protein  20.99 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.498101  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0918  CRISPR-associated Cas family protein  25.52 
 
 
240 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00903445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>