33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1676 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1676  CRISPR-associated Cas family protein  100 
 
 		 243 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.602428  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1394  CRISPR-associated Cas family protein  45.87 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0936  CRISPR-associated Cas family protein  45.9 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1884  CRISPR-associated Cas family protein  40.96 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2303  CRISPR-associated Cas family protein  38.75 
 
 		 240 aa  158  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4292  CRISPR-associated protein Cas6  36.36 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3942  CRISPR-associated protein Cas6  36.36 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000148244  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0971  CRISPR-associated protein Cas6  37.05 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1190  CRISPR-associated protein Cas6  35.39 
 
 		 248 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0535  CRISPR-associated Cas family protein  34.82 
 
 		 252 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0312  CRISPR-associated protein Cas6  32.89 
 
 		 249 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.196521  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2618  CRISPR-associated protein Cas6  30.98 
 
 		 267 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.032021  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1817  CRISPR-associated Cas family protein  31.4 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.536762  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0355  CRISPR-associated Cas family protein  32.93 
 
 		 242 aa  125  5e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0467  CRISPR-associated protein Cas6  34.26 
 
 		 250 aa  119  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0271  CRISPR-associated Cas6 family protein  34.4 
 
 		 257 aa  118  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2327  CRISPR-associated Cas family protein  33.46 
 
 		 251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1768  CRISPR-associated Cas family protein  32.23 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0625  CRISPR-associated protein Cas6  29.96 
 
 		 256 aa  108  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1099  CRISPR-associated Cas family protein  31.75 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000187286  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1007  CRISPR-associated Cas family protein  31.35 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000750551  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0524  CRISPR-associated protein Cas6  27.8 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0438  CRISPR-associated protein Cas6  28.52 
 
 		 266 aa  85.9  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2044  CRISPR-associated Cas family protein  24.3 
 
 		 267 aa  85.1  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0876015  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2448  CRISPR-associated protein Cas6  27.27 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.970754  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1121  CRISPR-associated Cas6 family protein  31.34 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1170  CRISPR-associated Cas family protein  27.98 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0816614 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0301  CRISPR-associated Cas6 family protein  28.33 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0414334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3847  CRISPR-associated protein Cas6  22.18 
 
 		 291 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2020  CRISPR-associated Cas5e family protein  21.58 
 
 		 221 aa  45.8  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1643  CRISPR-associated protein Cas6  21.4 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0578502  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0666  CRISPR-associated protein Cas6  25.09 
 
 		 252 aa  42.7  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2028  CRISPR-associated Cas family protein  23.83 
 
 		 233 aa  42.4  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>