28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0913 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0913  CRISPR-associated protein Cas6  100 
 
 
255 aa  522  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000034525  unclonable  0.000000000117947 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1593  CRISPR-associated protein Cas6  36.73 
 
 
242 aa  166  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.24413  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1224  CRISPR-associated protein Cas6  30.15 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2009  CRISPR-associated protein Cas6  29.8 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0121  CRISPR-associated protein Cas6  25 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.127158  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0918  CRISPR-associated Cas family protein  25 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00903445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2028  CRISPR-associated Cas family protein  23.6 
 
 
233 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0301  CRISPR-associated Cas6 family protein  26.88 
 
 
246 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0414334  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4292  CRISPR-associated protein Cas6  25.88 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160921  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1088  CRISPR-associated Cas family protein  27 
 
 
241 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0971  CRISPR-associated protein Cas6  31.25 
 
 
249 aa  59.7  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3942  CRISPR-associated protein Cas6  24.08 
 
 
246 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000148244  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1099  CRISPR-associated Cas family protein  20.47 
 
 
250 aa  56.2  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000187286  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1007  CRISPR-associated Cas family protein  21.32 
 
 
250 aa  55.8  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000750551  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0666  CRISPR-associated protein Cas6  22.68 
 
 
252 aa  55.5  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2303  CRISPR-associated Cas family protein  24.9 
 
 
240 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0438  CRISPR-associated protein Cas6  22.83 
 
 
266 aa  53.1  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1121  CRISPR-associated Cas6 family protein  29.27 
 
 
241 aa  53.1  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0467  CRISPR-associated protein Cas6  26.52 
 
 
250 aa  52  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0625  CRISPR-associated protein Cas6  25.19 
 
 
256 aa  50.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0535  CRISPR-associated Cas family protein  23.91 
 
 
252 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2327  CRISPR-associated Cas family protein  26.67 
 
 
251 aa  47  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1817  CRISPR-associated Cas family protein  28.91 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.536762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0120  CRISPR-associated Cas family protein  28.14 
 
 
235 aa  43.9  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000540082  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0355  CRISPR-associated Cas family protein  23.72 
 
 
242 aa  43.5  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2448  CRISPR-associated protein Cas6  21.11 
 
 
264 aa  42.4  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.970754  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0271  CRISPR-associated Cas6 family protein  22.39 
 
 
257 aa  42.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0936  CRISPR-associated Cas family protein  24.67 
 
 
240 aa  42  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>