36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2044 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2044  CRISPR-associated Cas family protein  100 
 
 
267 aa  554  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0876015  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2448  CRISPR-associated protein Cas6  70.08 
 
 
264 aa  396  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.970754  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0524  CRISPR-associated protein Cas6  55.85 
 
 
265 aa  320  9.999999999999999e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0438  CRISPR-associated protein Cas6  37.78 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1007  CRISPR-associated Cas family protein  31.25 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000750551  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1099  CRISPR-associated Cas family protein  30.51 
 
 
250 aa  125  9e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000187286  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4292  CRISPR-associated protein Cas6  29.06 
 
 
244 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160921  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0467  CRISPR-associated protein Cas6  31.82 
 
 
250 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0618  hypothetical protein  60 
 
 
119 aa  99.4  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3942  CRISPR-associated protein Cas6  29.48 
 
 
246 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000148244  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0971  CRISPR-associated protein Cas6  28.14 
 
 
249 aa  96.7  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0535  CRISPR-associated Cas family protein  28.57 
 
 
252 aa  96.3  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1884  CRISPR-associated Cas family protein  26.14 
 
 
248 aa  89.7  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3847  CRISPR-associated protein Cas6  27.15 
 
 
291 aa  89.4  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1394  CRISPR-associated Cas family protein  26.12 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2327  CRISPR-associated Cas family protein  27.65 
 
 
251 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0301  CRISPR-associated Cas6 family protein  27.89 
 
 
246 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0414334  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1676  CRISPR-associated Cas family protein  24.3 
 
 
243 aa  85.1  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.602428  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1121  CRISPR-associated Cas6 family protein  27.2 
 
 
241 aa  82.8  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0625  CRISPR-associated protein Cas6  24.53 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2303  CRISPR-associated Cas family protein  26.19 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0355  CRISPR-associated Cas family protein  26 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0936  CRISPR-associated Cas family protein  27.52 
 
 
240 aa  74.7  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1190  CRISPR-associated protein Cas6  24.63 
 
 
248 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0271  CRISPR-associated Cas6 family protein  27.14 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1768  CRISPR-associated Cas family protein  25.1 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0312  CRISPR-associated protein Cas6  24.91 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.196521  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2618  CRISPR-associated protein Cas6  24.18 
 
 
267 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.032021  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2218  hypothetical protein  23.42 
 
 
266 aa  62.8  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.498101  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1817  CRISPR-associated Cas family protein  23.85 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.536762  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1170  CRISPR-associated Cas family protein  25.44 
 
 
210 aa  52.4  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0816614 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2028  CRISPR-associated Cas family protein  27.47 
 
 
233 aa  49.3  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0932  CRISPR-associated protein Cas6  24.49 
 
 
229 aa  48.9  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0121  CRISPR-associated protein Cas6  24.03 
 
 
261 aa  42.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.127158  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1643  CRISPR-associated protein Cas6  27.68 
 
 
239 aa  42  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0578502  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2020  CRISPR-associated Cas5e family protein  21.84 
 
 
221 aa  42  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>