30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0271 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0271  CRISPR-associated Cas6 family protein  100 
 
 		 257 aa  519  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2618  CRISPR-associated protein Cas6  51.18 
 
 		 267 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.032021  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0535  CRISPR-associated Cas family protein  40.64 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0625  CRISPR-associated protein Cas6  34.68 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4292  CRISPR-associated protein Cas6  33.86 
 
 		 244 aa  148  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1817  CRISPR-associated Cas family protein  39.13 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.536762  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1190  CRISPR-associated protein Cas6  37.05 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0971  CRISPR-associated protein Cas6  38.1 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2303  CRISPR-associated Cas family protein  34.12 
 
 		 240 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1768  CRISPR-associated Cas family protein  31.92 
 
 		 261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1884  CRISPR-associated Cas family protein  31.1 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3942  CRISPR-associated protein Cas6  33.6 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000148244  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2327  CRISPR-associated Cas family protein  31.89 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1394  CRISPR-associated Cas family protein  31.75 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0312  CRISPR-associated protein Cas6  33.07 
 
 		 249 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.196521  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1676  CRISPR-associated Cas family protein  34.78 
 
 		 243 aa  122  8e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.602428  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0936  CRISPR-associated Cas family protein  32.05 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0467  CRISPR-associated protein Cas6  29.13 
 
 		 250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0524  CRISPR-associated protein Cas6  29.52 
 
 		 265 aa  99  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0355  CRISPR-associated Cas family protein  31.62 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1170  CRISPR-associated Cas family protein  37.27 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0816614 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2448  CRISPR-associated protein Cas6  29.71 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.970754  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1007  CRISPR-associated Cas family protein  29.62 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000750551  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1099  CRISPR-associated Cas family protein  28.85 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000187286  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2044  CRISPR-associated Cas family protein  28.36 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0876015  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0438  CRISPR-associated protein Cas6  26.02 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0301  CRISPR-associated Cas6 family protein  26.72 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0414334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1121  CRISPR-associated Cas6 family protein  25.59 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3847  CRISPR-associated protein Cas6  24.83 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1088  CRISPR-associated Cas family protein  23.41 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>