32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0355 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0355  CRISPR-associated Cas family protein  100 
 
 		 242 aa  483  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1884  CRISPR-associated Cas family protein  37.85 
 
 		 248 aa  148  7e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0971  CRISPR-associated protein Cas6  32.79 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0625  CRISPR-associated protein Cas6  36.44 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2303  CRISPR-associated Cas family protein  36.33 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0535  CRISPR-associated Cas family protein  34.13 
 
 		 252 aa  139  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3942  CRISPR-associated protein Cas6  34.47 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000148244  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4292  CRISPR-associated protein Cas6  32.03 
 
 		 244 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1676  CRISPR-associated Cas family protein  32.93 
 
 		 243 aa  125  5e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.602428  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1817  CRISPR-associated Cas family protein  30.49 
 
 		 264 aa  121  9e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.536762  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1768  CRISPR-associated Cas family protein  35.89 
 
 		 261 aa  118  9e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0936  CRISPR-associated Cas family protein  34.76 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0467  CRISPR-associated protein Cas6  31.37 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0312  CRISPR-associated protein Cas6  30.64 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.196521  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1190  CRISPR-associated protein Cas6  31.58 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1394  CRISPR-associated Cas family protein  31.43 
 
 		 247 aa  107  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2618  CRISPR-associated protein Cas6  30.71 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.032021  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2327  CRISPR-associated Cas family protein  29.2 
 
 		 251 aa  99.4  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0271  CRISPR-associated Cas6 family protein  31.62 
 
 		 257 aa  92  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1007  CRISPR-associated Cas family protein  26.42 
 
 		 250 aa  89  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000750551  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0524  CRISPR-associated protein Cas6  27.02 
 
 		 265 aa  85.1  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1099  CRISPR-associated Cas family protein  26.42 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000187286  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2044  CRISPR-associated Cas family protein  26 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0876015  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1121  CRISPR-associated Cas6 family protein  23.58 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0301  CRISPR-associated Cas6 family protein  25.1 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0414334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0438  CRISPR-associated protein Cas6  21.59 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2448  CRISPR-associated protein Cas6  22.58 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.970754  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1170  CRISPR-associated Cas family protein  26.77 
 
 		 210 aa  62  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0816614 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1593  CRISPR-associated protein Cas6  26.79 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.24413  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0666  CRISPR-associated protein Cas6  26.4 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0913  CRISPR-associated protein Cas6  23.72 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000034525  unclonable  0.000000000117947 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1733  hypothetical protein  27.96 
 
 		 226 aa  42.4  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>