30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1394 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1394  CRISPR-associated Cas family protein  100 
 
 		 247 aa  494  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1676  CRISPR-associated Cas family protein  45.87 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.602428  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1884  CRISPR-associated Cas family protein  40.56 
 
 		 248 aa  181  9.000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0971  CRISPR-associated protein Cas6  37.35 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3942  CRISPR-associated protein Cas6  35.37 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000148244  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2303  CRISPR-associated Cas family protein  38.31 
 
 		 240 aa  155  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0936  CRISPR-associated Cas family protein  39.39 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4292  CRISPR-associated protein Cas6  34.65 
 
 		 244 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0535  CRISPR-associated Cas family protein  34.02 
 
 		 252 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1190  CRISPR-associated protein Cas6  34.65 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1817  CRISPR-associated Cas family protein  32.82 
 
 		 264 aa  138  8.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.536762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0467  CRISPR-associated protein Cas6  33.33 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2618  CRISPR-associated protein Cas6  30.47 
 
 		 267 aa  125  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.032021  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2327  CRISPR-associated Cas family protein  32.56 
 
 		 251 aa  119  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0312  CRISPR-associated protein Cas6  33.06 
 
 		 249 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.196521  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0271  CRISPR-associated Cas6 family protein  31.35 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1768  CRISPR-associated Cas family protein  32.64 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0355  CRISPR-associated Cas family protein  31.43 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0625  CRISPR-associated protein Cas6  29.15 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0524  CRISPR-associated protein Cas6  27.76 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1007  CRISPR-associated Cas family protein  27.38 
 
 		 250 aa  89.4  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000750551  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2448  CRISPR-associated protein Cas6  26.79 
 
 		 264 aa  89  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.970754  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2044  CRISPR-associated Cas family protein  26.12 
 
 		 267 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0876015  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1099  CRISPR-associated Cas family protein  27.38 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000187286  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1170  CRISPR-associated Cas family protein  29.22 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0816614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3847  CRISPR-associated protein Cas6  24.37 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1593  CRISPR-associated protein Cas6  26.17 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.24413  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0438  CRISPR-associated protein Cas6  22.8 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1121  CRISPR-associated Cas6 family protein  29.7 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0301  CRISPR-associated Cas6 family protein  26.09 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0414334  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>