34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1007 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1007  CRISPR-associated Cas family protein  100 
 
 		 250 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000750551  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1099  CRISPR-associated Cas family protein  96.4 
 
 		 250 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000187286  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0524  CRISPR-associated protein Cas6  34.88 
 
 		 265 aa  139  6e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2448  CRISPR-associated protein Cas6  31.94 
 
 		 264 aa  129  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.970754  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2044  CRISPR-associated Cas family protein  31.25 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0876015  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1121  CRISPR-associated Cas6 family protein  32.67 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0438  CRISPR-associated protein Cas6  31.34 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0971  CRISPR-associated protein Cas6  31.15 
 
 		 249 aa  115  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4292  CRISPR-associated protein Cas6  30.04 
 
 		 244 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3942  CRISPR-associated protein Cas6  33.46 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000148244  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1190  CRISPR-associated protein Cas6  31.75 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0301  CRISPR-associated Cas6 family protein  30.92 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0414334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1676  CRISPR-associated Cas family protein  31.35 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.602428  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0535  CRISPR-associated Cas family protein  32.28 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0625  CRISPR-associated protein Cas6  29.48 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1884  CRISPR-associated Cas family protein  28.8 
 
 		 248 aa  95.1  9e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2303  CRISPR-associated Cas family protein  30 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0936  CRISPR-associated Cas family protein  29.49 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0467  CRISPR-associated protein Cas6  30.4 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1394  CRISPR-associated Cas family protein  27.38 
 
 		 247 aa  89.4  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0355  CRISPR-associated Cas family protein  26.42 
 
 		 242 aa  89  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0312  CRISPR-associated protein Cas6  27.89 
 
 		 249 aa  89  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.196521  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1817  CRISPR-associated Cas family protein  26.88 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.536762  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3847  CRISPR-associated protein Cas6  26.91 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2327  CRISPR-associated Cas family protein  27.41 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0271  CRISPR-associated Cas6 family protein  29.23 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1768  CRISPR-associated Cas family protein  27.09 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1170  CRISPR-associated Cas family protein  30.54 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0816614 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2618  CRISPR-associated protein Cas6  25.78 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.032021  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2020  CRISPR-associated Cas5e family protein  23.36 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0913  CRISPR-associated protein Cas6  21.32 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000034525  unclonable  0.000000000117947 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2218  hypothetical protein  24.53 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.498101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0932  CRISPR-associated protein Cas6  23.77 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1005  CRISPR-associated Cas family protein  21.46 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>