35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0438 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0438  CRISPR-associated protein Cas6  100 
 
 		 266 aa  551  1e-156  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2448  CRISPR-associated protein Cas6  38.32 
 
 		 264 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.970754  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2044  CRISPR-associated Cas family protein  37.78 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0876015  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0524  CRISPR-associated protein Cas6  35.79 
 
 		 265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1099  CRISPR-associated Cas family protein  32.09 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000187286  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1007  CRISPR-associated Cas family protein  31.34 
 
 		 250 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000750551  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3847  CRISPR-associated protein Cas6  29.63 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0625  CRISPR-associated protein Cas6  28.95 
 
 		 256 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0467  CRISPR-associated protein Cas6  27.24 
 
 		 250 aa  99  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4292  CRISPR-associated protein Cas6  26.57 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1676  CRISPR-associated Cas family protein  28.52 
 
 		 243 aa  85.9  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.602428  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0301  CRISPR-associated Cas6 family protein  26.18 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0414334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0971  CRISPR-associated protein Cas6  27.84 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0535  CRISPR-associated Cas family protein  24.34 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3942  CRISPR-associated protein Cas6  23.4 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000148244  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1121  CRISPR-associated Cas6 family protein  26.62 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1884  CRISPR-associated Cas family protein  23.42 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1817  CRISPR-associated Cas family protein  26.24 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.536762  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2303  CRISPR-associated Cas family protein  27.99 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0936  CRISPR-associated Cas family protein  24.15 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0355  CRISPR-associated Cas family protein  21.59 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1190  CRISPR-associated protein Cas6  21.05 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2618  CRISPR-associated protein Cas6  26.02 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.032021  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1643  CRISPR-associated protein Cas6  24.62 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0578502  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0271  CRISPR-associated Cas6 family protein  25.55 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1394  CRISPR-associated Cas family protein  22.8 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0312  CRISPR-associated protein Cas6  23.31 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.196521  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2020  CRISPR-associated Cas5e family protein  21.25 
 
 		 221 aa  53.9  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0913  CRISPR-associated protein Cas6  22.83 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000034525  unclonable  0.000000000117947 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2327  CRISPR-associated Cas family protein  23.62 
 
 		 251 aa  53.5  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2218  hypothetical protein  21.93 
 
 		 266 aa  53.1  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.498101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2009  CRISPR-associated protein Cas6  24.31 
 
 		 242 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1768  CRISPR-associated Cas family protein  25.1 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1170  CRISPR-associated Cas family protein  29.2 
 
 		 210 aa  46.2  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0816614 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0618  hypothetical protein  30.99 
 
 		 119 aa  43.9  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>