36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2448 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2448  CRISPR-associated protein Cas6  100 
 
 		 264 aa  552  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.970754  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2044  CRISPR-associated Cas family protein  70.08 
 
 		 267 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0876015  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0524  CRISPR-associated protein Cas6  60.15 
 
 		 265 aa  330  2e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0438  CRISPR-associated protein Cas6  38.32 
 
 		 266 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1099  CRISPR-associated Cas family protein  32.09 
 
 		 250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000187286  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1007  CRISPR-associated Cas family protein  31.94 
 
 		 250 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000750551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0467  CRISPR-associated protein Cas6  30.94 
 
 		 250 aa  119  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4292  CRISPR-associated protein Cas6  28.79 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0971  CRISPR-associated protein Cas6  30.71 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3942  CRISPR-associated protein Cas6  28.03 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000148244  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0535  CRISPR-associated Cas family protein  29.1 
 
 		 252 aa  95.9  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0618  hypothetical protein  56.41 
 
 		 119 aa  94  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1884  CRISPR-associated Cas family protein  26.89 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1394  CRISPR-associated Cas family protein  26.79 
 
 		 247 aa  89  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1817  CRISPR-associated Cas family protein  29.34 
 
 		 264 aa  89  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.536762  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1190  CRISPR-associated protein Cas6  28.84 
 
 		 248 aa  88.6  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2327  CRISPR-associated Cas family protein  28.41 
 
 		 251 aa  88.6  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3847  CRISPR-associated protein Cas6  26.71 
 
 		 291 aa  86.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0301  CRISPR-associated Cas6 family protein  29.32 
 
 		 246 aa  86.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0414334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2303  CRISPR-associated Cas family protein  26.4 
 
 		 240 aa  85.9  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1676  CRISPR-associated Cas family protein  27.27 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.602428  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0936  CRISPR-associated Cas family protein  28.57 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1768  CRISPR-associated Cas family protein  27.67 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1121  CRISPR-associated Cas6 family protein  26.89 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2618  CRISPR-associated protein Cas6  26.02 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.032021  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0625  CRISPR-associated protein Cas6  24.34 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0271  CRISPR-associated Cas6 family protein  29.71 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0312  CRISPR-associated protein Cas6  26.42 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.196521  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0355  CRISPR-associated Cas family protein  22.58 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1170  CRISPR-associated Cas family protein  28.4 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0816614 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2218  hypothetical protein  24.06 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.498101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0932  CRISPR-associated protein Cas6  23.21 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1643  CRISPR-associated protein Cas6  28.07 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0578502  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2020  CRISPR-associated Cas5e family protein  23.79 
 
 		 221 aa  43.5  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1021  CRISPR-associated protein Cas6  22.93 
 
 		 236 aa  43.1  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000207098  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0913  CRISPR-associated protein Cas6  21.11 
 
 		 255 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000034525  unclonable  0.000000000117947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>