18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1021 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1021  CRISPR-associated protein Cas6  100 
 
 		 236 aa  473  1e-132  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000207098  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1455  CRISPR-associated protein Cas6  27.27 
 
 		 271 aa  99  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2832  CRISPR-associated protein Cas6  25.88 
 
 		 267 aa  95.9  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3333  CRISPR-associated protein Cas6  26.27 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0897  CRISPR-associated protein Cas6  24.41 
 
 		 240 aa  62  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000104953  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0301  CRISPR-associated Cas6 family protein  24.7 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0414334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1121  CRISPR-associated Cas6 family protein  25.94 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0535  CRISPR-associated Cas family protein  26.69 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2448  CRISPR-associated protein Cas6  22.93 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.970754  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0355  CRISPR-associated Cas family protein  25.88 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4292  CRISPR-associated protein Cas6  27.35 
 
 		 244 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3006  hypothetical protein  23.66 
 
 		 232 aa  48.5  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.621051 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1884  CRISPR-associated Cas family protein  27.92 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1873  hypothetical protein  21.57 
 
 		 269 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0467  CRISPR-associated protein Cas6  26.77 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0971  CRISPR-associated protein Cas6  22.61 
 
 		 249 aa  46.2  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1809  hypothetical protein  23.79 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2303  CRISPR-associated Cas family protein  28.98 
 
 		 240 aa  41.6  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>