34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0535 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0535  CRISPR-associated Cas family protein  100 
 
 		 252 aa  522  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1817  CRISPR-associated Cas family protein  41.83 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.536762  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0971  CRISPR-associated protein Cas6  42.19 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4292  CRISPR-associated protein Cas6  40.96 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1884  CRISPR-associated Cas family protein  40.71 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2303  CRISPR-associated Cas family protein  38.15 
 
 		 240 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0936  CRISPR-associated Cas family protein  39.36 
 
 		 240 aa  172  5e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0271  CRISPR-associated Cas6 family protein  40.64 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0625  CRISPR-associated protein Cas6  35.2 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0312  CRISPR-associated protein Cas6  36.51 
 
 		 249 aa  158  9e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.196521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0467  CRISPR-associated protein Cas6  37.05 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1190  CRISPR-associated protein Cas6  33.6 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3942  CRISPR-associated protein Cas6  36.4 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000148244  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2618  CRISPR-associated protein Cas6  33.2 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.032021  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1676  CRISPR-associated Cas family protein  34.82 
 
 		 243 aa  149  6e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.602428  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2327  CRISPR-associated Cas family protein  35.27 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1394  CRISPR-associated Cas family protein  34.02 
 
 		 247 aa  145  6e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0355  CRISPR-associated Cas family protein  34.13 
 
 		 242 aa  139  6e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1768  CRISPR-associated Cas family protein  33.62 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1099  CRISPR-associated Cas family protein  32.02 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000187286  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1007  CRISPR-associated Cas family protein  32.28 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000750551  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2044  CRISPR-associated Cas family protein  28.57 
 
 		 267 aa  96.3  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0876015  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2448  CRISPR-associated protein Cas6  29.1 
 
 		 264 aa  95.9  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.970754  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0524  CRISPR-associated protein Cas6  28.09 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0438  CRISPR-associated protein Cas6  24.34 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0301  CRISPR-associated Cas6 family protein  24.8 
 
 		 246 aa  72  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0414334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1170  CRISPR-associated Cas family protein  30.29 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0816614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3847  CRISPR-associated protein Cas6  25.69 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1121  CRISPR-associated Cas6 family protein  21.91 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0932  CRISPR-associated protein Cas6  22.31 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1224  CRISPR-associated protein Cas6  24.62 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0913  CRISPR-associated protein Cas6  23.91 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000034525  unclonable  0.000000000117947 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1021  CRISPR-associated protein Cas6  26.32 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000207098  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0666  CRISPR-associated protein Cas6  26.32 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>