35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0301 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0301  CRISPR-associated Cas6 family protein  100 
 
 		 246 aa  503  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0414334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1121  CRISPR-associated Cas6 family protein  66.53 
 
 		 241 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1099  CRISPR-associated Cas family protein  31.33 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000187286  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1007  CRISPR-associated Cas family protein  30.92 
 
 		 250 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000750551  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2044  CRISPR-associated Cas family protein  27.89 
 
 		 267 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0876015  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2448  CRISPR-associated protein Cas6  29.32 
 
 		 264 aa  86.3  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.970754  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0438  CRISPR-associated protein Cas6  26.18 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3847  CRISPR-associated protein Cas6  25.59 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4292  CRISPR-associated protein Cas6  29.05 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3942  CRISPR-associated protein Cas6  27.92 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000148244  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0625  CRISPR-associated protein Cas6  24.91 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0535  CRISPR-associated Cas family protein  24.8 
 
 		 252 aa  72  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1817  CRISPR-associated Cas family protein  25 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.536762  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0355  CRISPR-associated Cas family protein  25.1 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2327  CRISPR-associated Cas family protein  28.69 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0936  CRISPR-associated Cas family protein  27.47 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0971  CRISPR-associated protein Cas6  24.37 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0524  CRISPR-associated protein Cas6  25.3 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1884  CRISPR-associated Cas family protein  29.6 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0913  CRISPR-associated protein Cas6  26.88 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000034525  unclonable  0.000000000117947 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2618  CRISPR-associated protein Cas6  26.94 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.032021  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1676  CRISPR-associated Cas family protein  28.33 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.602428  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1643  CRISPR-associated protein Cas6  24.68 
 
 		 239 aa  62  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0578502  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0467  CRISPR-associated protein Cas6  26.72 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2020  CRISPR-associated Cas5e family protein  27.02 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0312  CRISPR-associated protein Cas6  25.94 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.196521  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0932  CRISPR-associated protein Cas6  23.89 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1394  CRISPR-associated Cas family protein  26.09 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0271  CRISPR-associated Cas6 family protein  26.72 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2303  CRISPR-associated Cas family protein  25.86 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1021  CRISPR-associated protein Cas6  24.08 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000207098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1190  CRISPR-associated protein Cas6  25.63 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1088  CRISPR-associated Cas family protein  27.34 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0897  CRISPR-associated protein Cas6  23.36 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000104953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2009  CRISPR-associated protein Cas6  24.62 
 
 		 242 aa  42  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>