32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0524 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0524  CRISPR-associated protein Cas6  100 
 
 
265 aa  550  1e-155  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2448  CRISPR-associated protein Cas6  60.15 
 
 
264 aa  330  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.970754  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2044  CRISPR-associated Cas family protein  55.85 
 
 
267 aa  320  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0876015  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0438  CRISPR-associated protein Cas6  35.79 
 
 
266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1007  CRISPR-associated Cas family protein  34.88 
 
 
250 aa  139  7e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000750551  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1099  CRISPR-associated Cas family protein  34.11 
 
 
250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000187286  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1394  CRISPR-associated Cas family protein  27.76 
 
 
247 aa  104  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4292  CRISPR-associated protein Cas6  28.14 
 
 
244 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160921  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1676  CRISPR-associated Cas family protein  27.8 
 
 
243 aa  102  7e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.602428  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0467  CRISPR-associated protein Cas6  27.38 
 
 
250 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1884  CRISPR-associated Cas family protein  27.1 
 
 
248 aa  100  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0312  CRISPR-associated protein Cas6  30.68 
 
 
249 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.196521  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1190  CRISPR-associated protein Cas6  26.94 
 
 
248 aa  95.9  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2327  CRISPR-associated Cas family protein  28.78 
 
 
251 aa  95.5  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0535  CRISPR-associated Cas family protein  28.09 
 
 
252 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0271  CRISPR-associated Cas6 family protein  29.52 
 
 
257 aa  89  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0971  CRISPR-associated protein Cas6  26.69 
 
 
249 aa  87.8  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2303  CRISPR-associated Cas family protein  27.6 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3942  CRISPR-associated protein Cas6  28.17 
 
 
246 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000148244  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3847  CRISPR-associated protein Cas6  28.33 
 
 
291 aa  86.3  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0355  CRISPR-associated Cas family protein  27.02 
 
 
242 aa  85.1  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1817  CRISPR-associated Cas family protein  27.6 
 
 
264 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.536762  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0936  CRISPR-associated Cas family protein  27.91 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0625  CRISPR-associated protein Cas6  25.84 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0618  hypothetical protein  46.67 
 
 
119 aa  74.7  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2618  CRISPR-associated protein Cas6  25.94 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.032021  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0301  CRISPR-associated Cas6 family protein  25.3 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0414334  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1121  CRISPR-associated Cas6 family protein  24.6 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2218  hypothetical protein  27.03 
 
 
266 aa  62.8  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.498101  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1170  CRISPR-associated Cas family protein  25.88 
 
 
210 aa  59.7  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0816614 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1768  CRISPR-associated Cas family protein  25.1 
 
 
261 aa  58.5  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0932  CRISPR-associated protein Cas6  23.29 
 
 
229 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>