35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3942 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3942  CRISPR-associated protein Cas6  100 
 
 		 246 aa  499  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000148244  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4292  CRISPR-associated protein Cas6  52.46 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0971  CRISPR-associated protein Cas6  40.17 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1817  CRISPR-associated Cas family protein  39.11 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.536762  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1884  CRISPR-associated Cas family protein  35.56 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1394  CRISPR-associated Cas family protein  35.37 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0936  CRISPR-associated Cas family protein  36.44 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0625  CRISPR-associated protein Cas6  33.06 
 
 		 256 aa  155  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1676  CRISPR-associated Cas family protein  36.36 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.602428  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0535  CRISPR-associated Cas family protein  36.4 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2327  CRISPR-associated Cas family protein  38.49 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2303  CRISPR-associated Cas family protein  36.55 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1190  CRISPR-associated protein Cas6  34.94 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2618  CRISPR-associated protein Cas6  32.79 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.032021  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1768  CRISPR-associated Cas family protein  32.33 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0467  CRISPR-associated protein Cas6  33.2 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0355  CRISPR-associated Cas family protein  34.47 
 
 		 242 aa  135  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0271  CRISPR-associated Cas6 family protein  34 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0312  CRISPR-associated protein Cas6  32.66 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.196521  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1007  CRISPR-associated Cas family protein  33.46 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000750551  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1099  CRISPR-associated Cas family protein  32.68 
 
 		 250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000187286  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2448  CRISPR-associated protein Cas6  28.03 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.970754  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2044  CRISPR-associated Cas family protein  29.48 
 
 		 267 aa  98.6  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0876015  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1170  CRISPR-associated Cas family protein  31.65 
 
 		 210 aa  97.4  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0816614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3847  CRISPR-associated protein Cas6  29.49 
 
 		 291 aa  89.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0524  CRISPR-associated protein Cas6  28.17 
 
 		 265 aa  87  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0438  CRISPR-associated protein Cas6  23.4 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0301  CRISPR-associated Cas6 family protein  27.92 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0414334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1121  CRISPR-associated Cas6 family protein  24.89 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0913  CRISPR-associated protein Cas6  24.08 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000034525  unclonable  0.000000000117947 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2028  CRISPR-associated Cas family protein  22.92 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0918  CRISPR-associated Cas family protein  24.14 
 
 		 240 aa  48.9  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00903445  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2009  CRISPR-associated protein Cas6  24.28 
 
 		 242 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0932  CRISPR-associated protein Cas6  23.61 
 
 		 229 aa  45.4  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1224  CRISPR-associated protein Cas6  21.8 
 
 		 252 aa  42.4  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>