31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0936 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0936  CRISPR-associated Cas family protein  100 
 
 		 240 aa  484  1e-136  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1676  CRISPR-associated Cas family protein  45.9 
 
 		 243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.602428  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1884  CRISPR-associated Cas family protein  41.91 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0971  CRISPR-associated protein Cas6  39.18 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2303  CRISPR-associated Cas family protein  41.8 
 
 		 240 aa  175  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0535  CRISPR-associated Cas family protein  39.36 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4292  CRISPR-associated protein Cas6  36.78 
 
 		 244 aa  158  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2327  CRISPR-associated Cas family protein  38.4 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1394  CRISPR-associated Cas family protein  39.39 
 
 		 247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3942  CRISPR-associated protein Cas6  36.44 
 
 		 246 aa  155  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000148244  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0312  CRISPR-associated protein Cas6  35.59 
 
 		 249 aa  151  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.196521  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1190  CRISPR-associated protein Cas6  34.76 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2618  CRISPR-associated protein Cas6  33.05 
 
 		 267 aa  135  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.032021  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1817  CRISPR-associated Cas family protein  33.33 
 
 		 264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.536762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0467  CRISPR-associated protein Cas6  32.93 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0625  CRISPR-associated protein Cas6  36.33 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0355  CRISPR-associated Cas family protein  34.76 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0271  CRISPR-associated Cas6 family protein  31.2 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1768  CRISPR-associated Cas family protein  33.19 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1099  CRISPR-associated Cas family protein  30.64 
 
 		 250 aa  95.5  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000187286  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1007  CRISPR-associated Cas family protein  29.49 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000750551  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1170  CRISPR-associated Cas family protein  33.65 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0816614 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0524  CRISPR-associated protein Cas6  27.91 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2448  CRISPR-associated protein Cas6  28.57 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.970754  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2044  CRISPR-associated Cas family protein  27.52 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0876015  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1121  CRISPR-associated Cas6 family protein  31.12 
 
 		 241 aa  72  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0301  CRISPR-associated Cas6 family protein  27.47 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0414334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0438  CRISPR-associated protein Cas6  24.15 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3847  CRISPR-associated protein Cas6  23.89 
 
 		 291 aa  62  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1088  CRISPR-associated Cas family protein  23.36 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0913  CRISPR-associated protein Cas6  24.67 
 
 		 255 aa  42  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000034525  unclonable  0.000000000117947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>