32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0625 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0625  CRISPR-associated protein Cas6  100 
 
 
256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4292  CRISPR-associated protein Cas6  36.51 
 
 
244 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160921  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0535  CRISPR-associated Cas family protein  35.2 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1190  CRISPR-associated protein Cas6  34.41 
 
 
248 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3942  CRISPR-associated protein Cas6  33.06 
 
 
246 aa  155  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000148244  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0971  CRISPR-associated protein Cas6  33.47 
 
 
249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1817  CRISPR-associated Cas family protein  33.19 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.536762  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2618  CRISPR-associated protein Cas6  32.95 
 
 
267 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.032021  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0467  CRISPR-associated protein Cas6  36 
 
 
250 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0355  CRISPR-associated Cas family protein  36.44 
 
 
242 aa  143  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1884  CRISPR-associated Cas family protein  33.99 
 
 
248 aa  142  7e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2327  CRISPR-associated Cas family protein  35.97 
 
 
251 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0271  CRISPR-associated Cas6 family protein  34.68 
 
 
257 aa  139  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0312  CRISPR-associated protein Cas6  32.56 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.196521  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1768  CRISPR-associated Cas family protein  34.84 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0936  CRISPR-associated Cas family protein  36.33 
 
 
240 aa  129  6e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2303  CRISPR-associated Cas family protein  34.92 
 
 
240 aa  124  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1676  CRISPR-associated Cas family protein  29.96 
 
 
243 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.602428  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1170  CRISPR-associated Cas family protein  31.16 
 
 
210 aa  105  9e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0816614 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1394  CRISPR-associated Cas family protein  29.15 
 
 
247 aa  105  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0438  CRISPR-associated protein Cas6  28.95 
 
 
266 aa  101  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1007  CRISPR-associated Cas family protein  29.48 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000750551  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1099  CRISPR-associated Cas family protein  28 
 
 
250 aa  95.9  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000187286  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0524  CRISPR-associated protein Cas6  25.84 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2044  CRISPR-associated Cas family protein  24.53 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0876015  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2448  CRISPR-associated protein Cas6  24.34 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.970754  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1121  CRISPR-associated Cas6 family protein  28.24 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0301  CRISPR-associated Cas6 family protein  24.91 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0414334  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3847  CRISPR-associated protein Cas6  22.9 
 
 
291 aa  52.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0913  CRISPR-associated protein Cas6  25.19 
 
 
255 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000034525  unclonable  0.000000000117947 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1088  CRISPR-associated Cas family protein  25.41 
 
 
241 aa  43.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2009  CRISPR-associated protein Cas6  24.71 
 
 
242 aa  42  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>