26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1170 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1170  CRISPR-associated Cas family protein  100 
 
 		 210 aa  422  1e-117  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0816614 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0625  CRISPR-associated protein Cas6  31.16 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3942  CRISPR-associated protein Cas6  31.65 
 
 		 246 aa  97.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000148244  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4292  CRISPR-associated protein Cas6  30.73 
 
 		 244 aa  92.8  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0936  CRISPR-associated Cas family protein  33.65 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1817  CRISPR-associated Cas family protein  32.84 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.536762  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0971  CRISPR-associated protein Cas6  32.35 
 
 		 249 aa  86.7  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2618  CRISPR-associated protein Cas6  31.19 
 
 		 267 aa  86.3  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.032021  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1884  CRISPR-associated Cas family protein  28.05 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0467  CRISPR-associated protein Cas6  27.07 
 
 		 250 aa  81.6  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0271  CRISPR-associated Cas6 family protein  35.4 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2327  CRISPR-associated Cas family protein  26 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0312  CRISPR-associated protein Cas6  29.8 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.196521  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1394  CRISPR-associated Cas family protein  29.22 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2303  CRISPR-associated Cas family protein  30.12 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1007  CRISPR-associated Cas family protein  30.54 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000750551  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1768  CRISPR-associated Cas family protein  27.41 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0535  CRISPR-associated Cas family protein  30.29 
 
 		 252 aa  71.6  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1099  CRISPR-associated Cas family protein  29.94 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000187286  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1190  CRISPR-associated protein Cas6  29.65 
 
 		 248 aa  64.7  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1676  CRISPR-associated Cas family protein  27.98 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.602428  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2448  CRISPR-associated protein Cas6  28.4 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.970754  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0355  CRISPR-associated Cas family protein  26.77 
 
 		 242 aa  62  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0524  CRISPR-associated protein Cas6  25.88 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2044  CRISPR-associated Cas family protein  25.44 
 
 		 267 aa  52.4  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0876015  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0438  CRISPR-associated protein Cas6  29.2 
 
 		 266 aa  46.2  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>