31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1817 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1817  CRISPR-associated Cas family protein  100 
 
 
264 aa  545  1e-154  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.536762  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0971  CRISPR-associated protein Cas6  52.19 
 
 
249 aa  267  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0535  CRISPR-associated Cas family protein  41.83 
 
 
252 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4292  CRISPR-associated protein Cas6  39.92 
 
 
244 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160921  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3942  CRISPR-associated protein Cas6  39.11 
 
 
246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000148244  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1190  CRISPR-associated protein Cas6  38.87 
 
 
248 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2327  CRISPR-associated Cas family protein  34.26 
 
 
251 aa  158  9e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0467  CRISPR-associated protein Cas6  30.2 
 
 
250 aa  156  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0625  CRISPR-associated protein Cas6  33.19 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2618  CRISPR-associated protein Cas6  37.92 
 
 
267 aa  149  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.032021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2303  CRISPR-associated Cas family protein  34.94 
 
 
240 aa  148  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1884  CRISPR-associated Cas family protein  30.28 
 
 
248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0312  CRISPR-associated protein Cas6  35.86 
 
 
249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.196521  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1768  CRISPR-associated Cas family protein  33.89 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1394  CRISPR-associated Cas family protein  32.82 
 
 
247 aa  138  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0271  CRISPR-associated Cas6 family protein  38.34 
 
 
257 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0936  CRISPR-associated Cas family protein  33.33 
 
 
240 aa  133  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1676  CRISPR-associated Cas family protein  31.4 
 
 
243 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.602428  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0355  CRISPR-associated Cas family protein  30.49 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2448  CRISPR-associated protein Cas6  29.34 
 
 
264 aa  89  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.970754  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1007  CRISPR-associated Cas family protein  26.88 
 
 
250 aa  88.2  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000750551  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1099  CRISPR-associated Cas family protein  27.27 
 
 
250 aa  87.8  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000187286  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1170  CRISPR-associated Cas family protein  32.84 
 
 
210 aa  87.8  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0816614 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0524  CRISPR-associated protein Cas6  27.6 
 
 
265 aa  84  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3847  CRISPR-associated protein Cas6  28.32 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0438  CRISPR-associated protein Cas6  26.24 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0301  CRISPR-associated Cas6 family protein  25 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0414334  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1121  CRISPR-associated Cas6 family protein  24.21 
 
 
241 aa  63.9  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2044  CRISPR-associated Cas family protein  23.85 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0876015  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1088  CRISPR-associated Cas family protein  24.41 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0913  CRISPR-associated protein Cas6  28.91 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000034525  unclonable  0.000000000117947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>