More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1808 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2083  amino acid transport integral membrane protein  73.05 
 
 		 553 aa  747    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.842232  normal  0.31431 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1808  putative sodium:alanine symporter family protein  100 
 
 		 512 aa  1013    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.921517  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0020  amino acid carrier protein  81.63 
 
 		 518 aa  804    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000295702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1871  amino acid carrier protein  58.12 
 
 		 524 aa  555  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.766139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2069  amino acid carrier protein  59.07 
 
 		 502 aa  545  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0217883  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0495  Na+ linked D-alanine glycine permease component  52.81 
 
 		 504 aa  502  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0403  amino acid carrier protein  57.46 
 
 		 493 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06955  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  53.73 
 
 		 509 aa  489  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00095  putative Na(+)-linked D-alanine glycine permease  55.43 
 
 		 542 aa  478  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.82713  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4787  amino acid carrier protein  50.3 
 
 		 499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09140  amino acid carrier protein  48.42 
 
 		 523 aa  436  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.406042  normal  0.17016 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2725  sodium:alanine symporter  49.12 
 
 		 502 aa  436  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0222  Sodium:alanine symporter  47.36 
 
 		 481 aa  410  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00785043  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04350  amino acid carrier protein  46.03 
 
 		 513 aa  387  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18860  amino acid carrier protein  44.72 
 
 		 558 aa  384  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.280752  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3339  amino acid carrier protein  47.36 
 
 		 470 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0637643  normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2763  amino acid carrier protein  47.14 
 
 		 470 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4786  amino acid carrier protein  44.81 
 
 		 472 aa  363  3e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1604  amino acid carrier protein  46.88 
 
 		 498 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000273653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  44.91 
 
 		 458 aa  334  3e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4425  amino acid carrier protein  39.33 
 
 		 467 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4149  amino acid carrier protein  53.8 
 
 		 553 aa  309  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306456  normal  0.0111576 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  43.93 
 
 		 448 aa  300  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  41.05 
 
 		 455 aa  297  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  41.27 
 
 		 455 aa  297  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  41.05 
 
 		 455 aa  297  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  41.27 
 
 		 455 aa  297  4e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  41.05 
 
 		 455 aa  296  6e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  41.05 
 
 		 455 aa  296  6e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  41.05 
 
 		 455 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  40.61 
 
 		 455 aa  295  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  41.05 
 
 		 455 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  40.83 
 
 		 455 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  42.26 
 
 		 445 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4913  amino acid carrier protein  36.72 
 
 		 454 aa  280  6e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.176306 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1722  amino acid carrier protein  40.23 
 
 		 471 aa  279  8e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.878155 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  39.7 
 
 		 459 aa  278  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  40.62 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  39.91 
 
 		 449 aa  278  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0284  sodium/alanine symporter  37.34 
 
 		 477 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1046  sodium/alanine symporter family protein  36.82 
 
 		 488 aa  275  2.0000000000000002e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.15016  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1649  amino acid carrier protein  47.46 
 
 		 575 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.889938  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  39.83 
 
 		 452 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  38.95 
 
 		 459 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  39.18 
 
 		 452 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  39.18 
 
 		 452 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  39.18 
 
 		 452 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  42.11 
 
 		 443 aa  272  1e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  39.54 
 
 		 452 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  40.33 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  41.02 
 
 		 464 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  41.77 
 
 		 460 aa  270  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  41.77 
 
 		 458 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  41.77 
 
 		 458 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  41.83 
 
 		 457 aa  269  7e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  41.53 
 
 		 458 aa  269  8e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  41.53 
 
 		 458 aa  269  8e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  44.22 
 
 		 454 aa  268  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  38.37 
 
 		 443 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  41.14 
 
 		 448 aa  268  2.9999999999999995e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  40.8 
 
 		 458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  39.87 
 
 		 435 aa  266  5e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2251  sodium:alanine symporter  39.84 
 
 		 490 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01260  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  46.52 
 
 		 543 aa  266  7e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291122  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  41.33 
 
 		 456 aa  266  8e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  40.41 
 
 		 476 aa  265  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0060  amino acid carrier protein  40.57 
 
 		 503 aa  265  1e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.706762 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  38.16 
 
 		 453 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  40.13 
 
 		 455 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1821  amino acid carrier protein  42.05 
 
 		 467 aa  265  2e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  38.04 
 
 		 457 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  40.4 
 
 		 447 aa  265  2e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  41.04 
 
 		 459 aa  264  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  43 
 
 		 461 aa  263  4e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  42.31 
 
 		 443 aa  263  6.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  37.28 
 
 		 453 aa  262  1e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  37.5 
 
 		 460 aa  261  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0834  Sodium:alanine symporter  39.71 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  37.95 
 
 		 452 aa  260  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  42.68 
 
 		 453 aa  260  4e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2711  Sodium/alanine symporter  38.19 
 
 		 456 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.102473  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  40.7 
 
 		 457 aa  259  7e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  39.74 
 
 		 445 aa  259  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1336  amino acid carrier protein  38.09 
 
 		 457 aa  259  1e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000270325  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  37.32 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  37.32 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  37.11 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  38.53 
 
 		 447 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  39.5 
 
 		 464 aa  257  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  41.03 
 
 		 441 aa  257  4e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0666  amino acid carrier protein  39.54 
 
 		 487 aa  256  7e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.761891  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  36.82 
 
 		 463 aa  256  9e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  41.45 
 
 		 460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0294  Sodium:alanine symporter  32.38 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  40.59 
 
 		 459 aa  254  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  39.2 
 
 		 460 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  39.06 
 
 		 424 aa  253  8.000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1973  amino acid carrier protein  39.33 
 
 		 458 aa  252  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.123631 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  39.08 
 
 		 457 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  37.14 
 
 		 456 aa  251  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>