More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1604 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1604  amino acid carrier protein  100 
 
 
498 aa  994    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000273653 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3339  amino acid carrier protein  61.72 
 
 
470 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0637643  normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2763  amino acid carrier protein  61.51 
 
 
470 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4787  amino acid carrier protein  55.86 
 
 
499 aa  489  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2069  amino acid carrier protein  49.29 
 
 
502 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0217883  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4786  amino acid carrier protein  52.03 
 
 
472 aa  439  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2725  sodium:alanine symporter  46.04 
 
 
502 aa  432  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1871  amino acid carrier protein  47.57 
 
 
524 aa  431  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.766139  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0495  Na+ linked D-alanine glycine permease component  46.59 
 
 
504 aa  422  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304972  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0222  Sodium:alanine symporter  43.15 
 
 
481 aa  409  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00785043  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0403  amino acid carrier protein  48.73 
 
 
493 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00095  putative Na(+)-linked D-alanine glycine permease  44.79 
 
 
542 aa  403  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.82713  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0020  amino acid carrier protein  44.71 
 
 
518 aa  386  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000295702  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1808  putative sodium:alanine symporter family protein  46.64 
 
 
512 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.921517  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2083  amino acid transport integral membrane protein  44.42 
 
 
553 aa  376  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.842232  normal  0.31431 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06955  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  42.97 
 
 
509 aa  374  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09140  amino acid carrier protein  42.01 
 
 
523 aa  351  1e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.406042  normal  0.17016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  45.45 
 
 
458 aa  342  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18860  amino acid carrier protein  40.21 
 
 
558 aa  331  2e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.280752  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1722  amino acid carrier protein  42.44 
 
 
471 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.878155 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04350  amino acid carrier protein  39.63 
 
 
513 aa  303  3.0000000000000004e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4425  amino acid carrier protein  37.1 
 
 
467 aa  302  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2026  amino acid carrier protein  39.59 
 
 
433 aa  301  2e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0781  sodium:alanine symporter family protein  39.02 
 
 
460 aa  300  5e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1046  sodium/alanine symporter family protein  36.7 
 
 
488 aa  298  1e-79  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.15016  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  40.95 
 
 
459 aa  297  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0294  Sodium:alanine symporter  38.2 
 
 
460 aa  293  5e-78  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  45.21 
 
 
454 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  41.24 
 
 
456 aa  290  3e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  37.69 
 
 
455 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  42.06 
 
 
449 aa  289  8e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  43.34 
 
 
448 aa  289  9e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  37.69 
 
 
455 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  37.77 
 
 
455 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  37.69 
 
 
455 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  37.69 
 
 
455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  37.23 
 
 
455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4913  amino acid carrier protein  38.51 
 
 
454 aa  286  4e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.176306 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  37.26 
 
 
455 aa  286  5e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  37.47 
 
 
455 aa  286  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  37.55 
 
 
455 aa  286  7e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  37.44 
 
 
455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  37.34 
 
 
455 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  36.92 
 
 
460 aa  283  5.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  38.43 
 
 
453 aa  282  9e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  38.65 
 
 
453 aa  282  1e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  38.31 
 
 
457 aa  281  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  39.72 
 
 
458 aa  279  9e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  36.52 
 
 
463 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  39.82 
 
 
457 aa  279  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  37.55 
 
 
452 aa  277  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  38.85 
 
 
435 aa  277  4e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1047  sodium/alanine symporter family protein  37.56 
 
 
447 aa  276  6e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  37.8 
 
 
452 aa  276  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  37.8 
 
 
452 aa  276  8e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  35.48 
 
 
458 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  39.18 
 
 
476 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  38.41 
 
 
443 aa  274  3e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  38.91 
 
 
458 aa  274  3e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  36.94 
 
 
456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  39.05 
 
 
464 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  39.41 
 
 
459 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  35.44 
 
 
462 aa  272  9e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  37.42 
 
 
452 aa  272  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  39.29 
 
 
459 aa  271  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  37.36 
 
 
452 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  35.82 
 
 
459 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  35.23 
 
 
462 aa  269  8e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  39.39 
 
 
460 aa  268  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  38.04 
 
 
456 aa  268  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  39.74 
 
 
457 aa  268  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  39.29 
 
 
458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  39.29 
 
 
458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  39.29 
 
 
458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  39.29 
 
 
458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  36.77 
 
 
464 aa  267  4e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  38.41 
 
 
458 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  35.73 
 
 
458 aa  266  8e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  37.3 
 
 
443 aa  265  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1821  amino acid carrier protein  42.68 
 
 
467 aa  265  2e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  35.93 
 
 
452 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  35.97 
 
 
452 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  36.94 
 
 
456 aa  264  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  35.97 
 
 
452 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  35.97 
 
 
452 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  39.61 
 
 
459 aa  264  4e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  40.81 
 
 
453 aa  263  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21681  Sodium:alanine symporter family protein  39.19 
 
 
464 aa  263  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0888234 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  37.47 
 
 
460 aa  262  8e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  39.55 
 
 
447 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0284  sodium/alanine symporter  36.66 
 
 
477 aa  261  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  36.26 
 
 
457 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  37.87 
 
 
441 aa  258  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0060  amino acid carrier protein  39.19 
 
 
503 aa  258  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.706762 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  38.29 
 
 
448 aa  257  3e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12690  amino acid carrier protein  36.58 
 
 
498 aa  258  3e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0666  amino acid carrier protein  41.67 
 
 
487 aa  256  8e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.761891  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  37.11 
 
 
424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2711  Sodium/alanine symporter  36.92 
 
 
456 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.102473  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01260  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  43.87 
 
 
543 aa  254  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>