More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4913 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0284  sodium/alanine symporter  73.14 
 
 		 477 aa  647    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4913  amino acid carrier protein  100 
 
 		 454 aa  914    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.176306 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2026  amino acid carrier protein  50.11 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2711  Sodium/alanine symporter  51.36 
 
 		 456 aa  443  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.102473  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1871  amino acid carrier protein  39.42 
 
 		 524 aa  316  5e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.766139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  40.4 
 
 		 458 aa  311  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2069  amino acid carrier protein  38.31 
 
 		 502 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0217883  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  39.51 
 
 		 458 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  39.51 
 
 		 458 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  39.29 
 
 		 458 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  39.29 
 
 		 458 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  38.67 
 
 		 449 aa  298  9e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2703  amino acid carrier protein  40.85 
 
 		 464 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  39.24 
 
 		 456 aa  296  5e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  38.34 
 
 		 457 aa  296  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31800  putative sodium:alanine symporter  40.62 
 
 		 449 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139777  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  38.1 
 
 		 460 aa  295  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  39.06 
 
 		 459 aa  294  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0495  Na+ linked D-alanine glycine permease component  37.36 
 
 		 504 aa  291  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  39.73 
 
 		 459 aa  290  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  37.89 
 
 		 455 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  38.62 
 
 		 457 aa  289  6e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28840  Sodium:alanine symporter  42.18 
 
 		 447 aa  288  9e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  37.14 
 
 		 455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  39.04 
 
 		 458 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2083  amino acid transport integral membrane protein  35.78 
 
 		 553 aa  286  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.842232  normal  0.31431 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  36.92 
 
 		 455 aa  286  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  38.39 
 
 		 459 aa  286  4e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3765  sodium:alanine symporter  78.77 
 
 		 184 aa  286  4e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.318841  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  37.72 
 
 		 456 aa  286  5e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  36.92 
 
 		 455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  36.7 
 
 		 455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  36.7 
 
 		 455 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  36.7 
 
 		 455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  36.7 
 
 		 455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  36.48 
 
 		 455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  38.43 
 
 		 453 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  42.14 
 
 		 461 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  36.7 
 
 		 455 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  36.26 
 
 		 455 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1808  putative sodium:alanine symporter family protein  36.72 
 
 		 512 aa  279  7e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.921517  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  39.33 
 
 		 448 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  39.43 
 
 		 458 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00095  putative Na(+)-linked D-alanine glycine permease  35.4 
 
 		 542 aa  277  3e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.82713  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2725  sodium:alanine symporter  35.62 
 
 		 502 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  36.32 
 
 		 460 aa  273  6e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  36.36 
 
 		 445 aa  272  7e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4149  amino acid carrier protein  45.48 
 
 		 553 aa  272  8.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306456  normal  0.0111576 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  37.77 
 
 		 464 aa  271  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  37.56 
 
 		 448 aa  271  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  38.04 
 
 		 457 aa  271  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0109  amino acid carrier protein  35.79 
 
 		 505 aa  271  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.108225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4787  amino acid carrier protein  35.56 
 
 		 499 aa  270  5e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1604  amino acid carrier protein  39.09 
 
 		 498 aa  269  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000273653 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0020  amino acid carrier protein  35.39 
 
 		 518 aa  269  8.999999999999999e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000295702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  37.74 
 
 		 452 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  36.88 
 
 		 452 aa  268  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  37.74 
 
 		 452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1722  amino acid carrier protein  40.3 
 
 		 471 aa  267  4e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.878155 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  38.94 
 
 		 446 aa  267  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  36.22 
 
 		 453 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  35.78 
 
 		 453 aa  266  8e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  38.22 
 
 		 443 aa  265  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06955  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  36.4 
 
 		 509 aa  265  1e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  37.61 
 
 		 456 aa  265  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  37.61 
 
 		 462 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  38.51 
 
 		 459 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  36.98 
 
 		 452 aa  264  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  37.67 
 
 		 462 aa  264  3e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4786  amino acid carrier protein  36.69 
 
 		 472 aa  264  3e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  36.24 
 
 		 445 aa  263  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  37.19 
 
 		 463 aa  263  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  36.62 
 
 		 452 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  37.2 
 
 		 452 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  37.2 
 
 		 452 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  37.2 
 
 		 452 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  37.2 
 
 		 452 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  37.97 
 
 		 494 aa  262  6.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  36.34 
 
 		 498 aa  263  6.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  37.2 
 
 		 458 aa  262  8.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  36.99 
 
 		 424 aa  261  2e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0163  amino acid carrier protein  36.91 
 
 		 457 aa  261  2e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1608  amino acid carrier protein  38.04 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276602  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17880  amino acid carrier protein  36.21 
 
 		 492 aa  259  6e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  37.04 
 
 		 435 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0403  amino acid carrier protein  37.33 
 
 		 493 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0222  Sodium:alanine symporter  32.77 
 
 		 481 aa  258  1e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00785043  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  37.93 
 
 		 457 aa  256  5e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  38.19 
 
 		 477 aa  256  5e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  36.82 
 
 		 456 aa  256  7e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3166  amino acid carrier protein  36.44 
 
 		 459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18860  amino acid carrier protein  37.07 
 
 		 558 aa  254  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.280752  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2763  amino acid carrier protein  36.42 
 
 		 470 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  36.32 
 
 		 464 aa  253  6e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3339  amino acid carrier protein  36.12 
 
 		 470 aa  253  7e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0637643  normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2767  amino acid carrier protein  35.98 
 
 		 450 aa  251  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.070089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  36.81 
 
 		 443 aa  250  4e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0281  amino acid carrier protein  36.04 
 
 		 502 aa  249  6e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000471022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09140  amino acid carrier protein  36.96 
 
 		 523 aa  249  6e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.406042  normal  0.17016 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4425  amino acid carrier protein  33.49 
 
 		 467 aa  249  8e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>