More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1722 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1722  amino acid carrier protein  100 
 
 		 471 aa  921    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.878155 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  67.97 
 
 		 458 aa  593  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  48.28 
 
 		 448 aa  391  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  49.05 
 
 		 456 aa  384  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  48.91 
 
 		 449 aa  379  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  44.54 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  44.54 
 
 		 455 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  44.33 
 
 		 455 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  44.33 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  44.11 
 
 		 455 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  44.33 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  46.84 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  44.33 
 
 		 455 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  44.33 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  44.33 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  44.54 
 
 		 455 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  48.16 
 
 		 453 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  44.35 
 
 		 462 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  45.36 
 
 		 457 aa  364  2e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  45.57 
 
 		 456 aa  363  3e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  46.64 
 
 		 458 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  46.19 
 
 		 459 aa  363  4e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  46.64 
 
 		 458 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  44.14 
 
 		 462 aa  363  5.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  47.51 
 
 		 457 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  46.64 
 
 		 458 aa  362  6e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  46.64 
 
 		 458 aa  362  6e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  45.09 
 
 		 460 aa  361  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2767  amino acid carrier protein  50.33 
 
 		 450 aa  360  4e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.070089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  45.79 
 
 		 456 aa  358  8e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  45.3 
 
 		 458 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  45.92 
 
 		 445 aa  354  2e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  44.9 
 
 		 463 aa  354  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  43.38 
 
 		 441 aa  351  2e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  43.83 
 
 		 458 aa  351  2e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  46.65 
 
 		 458 aa  350  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  43.95 
 
 		 459 aa  350  3e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  51.49 
 
 		 459 aa  350  4e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  43.88 
 
 		 464 aa  350  4e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  49.33 
 
 		 454 aa  349  5e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  45.92 
 
 		 464 aa  347  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  44.47 
 
 		 458 aa  348  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1973  amino acid carrier protein  45.59 
 
 		 458 aa  346  5e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.123631 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  46.19 
 
 		 455 aa  346  6e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  43.11 
 
 		 443 aa  345  7e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  49.78 
 
 		 446 aa  345  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2703  amino acid carrier protein  44.7 
 
 		 464 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  44.07 
 
 		 459 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  45.57 
 
 		 443 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  45.99 
 
 		 459 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  44.59 
 
 		 460 aa  342  5.999999999999999e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  43.83 
 
 		 460 aa  342  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31800  putative sodium:alanine symporter  44.78 
 
 		 449 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  44.02 
 
 		 452 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  44.02 
 
 		 452 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  44.02 
 
 		 452 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  44.02 
 
 		 452 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  44.56 
 
 		 452 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  46.8 
 
 		 453 aa  339  7e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  45.21 
 
 		 448 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  45.06 
 
 		 457 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  43.16 
 
 		 447 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  44.97 
 
 		 452 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  47.94 
 
 		 453 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  45.71 
 
 		 452 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  47.31 
 
 		 461 aa  335  9e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  46.97 
 
 		 435 aa  335  1e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  45.41 
 
 		 445 aa  335  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  44.54 
 
 		 452 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  44.3 
 
 		 452 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28840  Sodium:alanine symporter  48.29 
 
 		 447 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2245  amino acid carrier protein  44.95 
 
 		 468 aa  333  3e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1133  amino acid carrier protein  43.23 
 
 		 456 aa  332  9e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  44.71 
 
 		 443 aa  331  2e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2725  sodium:alanine symporter  42.36 
 
 		 502 aa  331  2e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3166  amino acid carrier protein  44.95 
 
 		 459 aa  330  3e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  47.26 
 
 		 447 aa  329  6e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1664  seryl-tRNA synthetase, class IIA  46.28 
 
 		 452 aa  329  6e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0197857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1604  amino acid carrier protein  42.27 
 
 		 498 aa  328  9e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000273653 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  45.08 
 
 		 457 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1821  amino acid carrier protein  45.51 
 
 		 467 aa  327  4.0000000000000003e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0403  amino acid carrier protein  45.1 
 
 		 493 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0060  amino acid carrier protein  44.11 
 
 		 503 aa  325  9e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.706762 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21681  Sodium:alanine symporter family protein  45.79 
 
 		 464 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0888234 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0368  amino acid carrier protein  41.28 
 
 		 451 aa  325  1e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000970174  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  43.66 
 
 		 456 aa  325  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00095  putative Na(+)-linked D-alanine glycine permease  41.24 
 
 		 542 aa  324  2e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.82713  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  45.14 
 
 		 476 aa  323  3e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1608  amino acid carrier protein  44.23 
 
 		 456 aa  323  5e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276602  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1871  amino acid carrier protein  41.18 
 
 		 524 aa  321  1.9999999999999998e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.766139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2069  amino acid carrier protein  42.08 
 
 		 502 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0217883  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0495  Na+ linked D-alanine glycine permease component  41.69 
 
 		 504 aa  315  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  47.29 
 
 		 424 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0109  amino acid carrier protein  46.17 
 
 		 505 aa  315  1.9999999999999998e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.108225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1827  branched-chain amino acid transport protein  40.13 
 
 		 472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  43.05 
 
 		 460 aa  313  4.999999999999999e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1156  amino acid carrier protein  41.93 
 
 		 456 aa  311  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.086195 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17880  amino acid carrier protein  44.33 
 
 		 492 aa  311  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2159  Na+/alanine symporter  42.92 
 
 		 460 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2730  amino acid carrier protein  39.22 
 
 		 469 aa  309  6.999999999999999e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>