More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0496 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  84.68 
 
 		 452 aa  746    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  84.68 
 
 		 452 aa  746    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  85.93 
 
 		 456 aa  767    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  85.33 
 
 		 452 aa  752    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  84.33 
 
 		 459 aa  765    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  100 
 
 		 457 aa  901    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  78.56 
 
 		 464 aa  721    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  85.18 
 
 		 457 aa  775    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  84.23 
 
 		 452 aa  749    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  84.68 
 
 		 452 aa  746    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  85.33 
 
 		 452 aa  754    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  85.33 
 
 		 452 aa  756    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  84.68 
 
 		 452 aa  746    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  86.23 
 
 		 452 aa  760    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  63.2 
 
 		 460 aa  560  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  62.36 
 
 		 456 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  60.87 
 
 		 463 aa  527  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  61.49 
 
 		 458 aa  521  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  59.13 
 
 		 462 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  58.84 
 
 		 462 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  62.33 
 
 		 458 aa  512  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2245  amino acid carrier protein  63.29 
 
 		 468 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1608  amino acid carrier protein  60.87 
 
 		 456 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276602  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  56.95 
 
 		 448 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2656  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  61.65 
 
 		 426 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168097  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2159  Na+/alanine symporter  60.62 
 
 		 460 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0461  D-alanine glycine permease  60.84 
 
 		 458 aa  455  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0104177  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  54.46 
 
 		 447 aa  457  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  53.51 
 
 		 455 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  52.63 
 
 		 455 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  52.63 
 
 		 455 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  52.85 
 
 		 455 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  52.85 
 
 		 455 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  52.63 
 
 		 455 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  52.85 
 
 		 455 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  52.85 
 
 		 455 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  52.63 
 
 		 455 aa  443  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  52.19 
 
 		 455 aa  442  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  52.85 
 
 		 457 aa  442  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  53.19 
 
 		 456 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  55.26 
 
 		 464 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  52.1 
 
 		 455 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  50.77 
 
 		 458 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  52.53 
 
 		 457 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  51.99 
 
 		 458 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  51.99 
 
 		 458 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  51.2 
 
 		 459 aa  420  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  54.36 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  51.99 
 
 		 458 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  51.99 
 
 		 458 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  50.33 
 
 		 459 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  50.65 
 
 		 459 aa  414  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0109  amino acid carrier protein  48.94 
 
 		 505 aa  411  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.108225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  51.43 
 
 		 453 aa  405  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31800  putative sodium:alanine symporter  52.02 
 
 		 449 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139777  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  50 
 
 		 460 aa  402  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  49.77 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3166  amino acid carrier protein  52.63 
 
 		 459 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2703  amino acid carrier protein  51.81 
 
 		 464 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  48.7 
 
 		 460 aa  395  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  49.44 
 
 		 443 aa  397  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  49.12 
 
 		 456 aa  396  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  49.89 
 
 		 453 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  49.89 
 
 		 453 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17880  amino acid carrier protein  48.21 
 
 		 492 aa  389  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12690  amino acid carrier protein  47.71 
 
 		 498 aa  386  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  48.87 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  50.11 
 
 		 445 aa  385  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  49.52 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  48.56 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28840  Sodium:alanine symporter  50.33 
 
 		 447 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  50.11 
 
 		 443 aa  376  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  50.11 
 
 		 448 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  50.88 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  49.77 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1664  seryl-tRNA synthetase, class IIA  50.22 
 
 		 452 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0197857  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  45.65 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  50.35 
 
 		 424 aa  364  1e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  48.44 
 
 		 476 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1016  amino acid carrier protein  46.22 
 
 		 471 aa  356  5.999999999999999e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.190269  normal  0.164712 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  43.64 
 
 		 458 aa  354  2e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0368  amino acid carrier protein  43.52 
 
 		 451 aa  354  2e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000970174  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  45.95 
 
 		 460 aa  352  5.9999999999999994e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  48.55 
 
 		 446 aa  352  5.9999999999999994e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  48.34 
 
 		 454 aa  347  2e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1336  amino acid carrier protein  45.29 
 
 		 457 aa  347  2e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000270325  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  47.86 
 
 		 447 aa  347  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3038  amino acid carrier protein  47.62 
 
 		 470 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1156  amino acid carrier protein  40.69 
 
 		 456 aa  345  1e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.086195 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1821  amino acid carrier protein  46.9 
 
 		 467 aa  339  5.9999999999999996e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0586  amino acid carrier protein  50 
 
 		 472 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2767  amino acid carrier protein  47.29 
 
 		 450 aa  334  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.070089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12520  amino acid carrier protein  43.45 
 
 		 479 aa  334  2e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21681  Sodium:alanine symporter family protein  44.57 
 
 		 464 aa  334  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0888234 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0666  amino acid carrier protein  49.2 
 
 		 487 aa  334  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.761891  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02580  amino acid carrier protein  43.86 
 
 		 472 aa  332  6e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.587535 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1827  branched-chain amino acid transport protein  42.83 
 
 		 472 aa  332  1e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0040  amino acid carrier protein  45.91 
 
 		 469 aa  328  1.0000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.489781 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2251  sodium:alanine symporter  46.27 
 
 		 490 aa  324  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0834  Sodium:alanine symporter  45.31 
 
 		 456 aa  323  3e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>