More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3166 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  80.04 
 
 		 459 aa  705    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  75.77 
 
 		 460 aa  677    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  80.44 
 
 		 459 aa  726    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3166  amino acid carrier protein  100 
 
 		 459 aa  900    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  82.6 
 
 		 458 aa  735    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  78.43 
 
 		 459 aa  724    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  82.6 
 
 		 458 aa  734    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  79.65 
 
 		 456 aa  721    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  81.4 
 
 		 458 aa  732    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  80.22 
 
 		 457 aa  727    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  81.98 
 
 		 457 aa  726    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  82.6 
 
 		 458 aa  734    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  82.6 
 
 		 458 aa  735    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  70.44 
 
 		 453 aa  613  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31800  putative sodium:alanine symporter  65.62 
 
 		 449 aa  564  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2703  amino acid carrier protein  64.96 
 
 		 464 aa  561  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  67.71 
 
 		 461 aa  550  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  61.15 
 
 		 458 aa  540  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28840  Sodium:alanine symporter  62.36 
 
 		 447 aa  525  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  60.09 
 
 		 456 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  55.56 
 
 		 449 aa  486  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  59.42 
 
 		 446 aa  481  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1664  seryl-tRNA synthetase, class IIA  59.87 
 
 		 452 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0197857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  55.23 
 
 		 445 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  50.32 
 
 		 456 aa  449  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  55.83 
 
 		 447 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  50.22 
 
 		 455 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  57.08 
 
 		 445 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  50.54 
 
 		 462 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  49.78 
 
 		 455 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  49.78 
 
 		 455 aa  436  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  50.54 
 
 		 462 aa  438  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  49.57 
 
 		 455 aa  436  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  49.57 
 
 		 455 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  49.57 
 
 		 455 aa  434  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21681  Sodium:alanine symporter family protein  52.78 
 
 		 464 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0888234 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  49.78 
 
 		 455 aa  434  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  49.57 
 
 		 455 aa  433  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  50.76 
 
 		 463 aa  433  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  49.57 
 
 		 455 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  49.57 
 
 		 455 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  50.33 
 
 		 459 aa  429  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  50.22 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  50.66 
 
 		 457 aa  430  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  52.94 
 
 		 452 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  49.57 
 
 		 460 aa  431  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  52.94 
 
 		 464 aa  425  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  52.63 
 
 		 457 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  52.26 
 
 		 452 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  51.78 
 
 		 452 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  51.8 
 
 		 452 aa  423  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  52.26 
 
 		 452 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  51.33 
 
 		 464 aa  424  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  50 
 
 		 458 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  50.9 
 
 		 452 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  50.9 
 
 		 452 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  50.9 
 
 		 452 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  52.34 
 
 		 443 aa  416  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  50.9 
 
 		 452 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0834  Sodium:alanine symporter  53.22 
 
 		 456 aa  413  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  50 
 
 		 456 aa  415  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1821  amino acid carrier protein  53.06 
 
 		 467 aa  409  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  52.19 
 
 		 454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  49.03 
 
 		 476 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  46.14 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  51.76 
 
 		 455 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  51.7 
 
 		 459 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  48.55 
 
 		 448 aa  397  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2245  amino acid carrier protein  51.2 
 
 		 468 aa  398  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  47.4 
 
 		 460 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  48.21 
 
 		 441 aa  394  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1608  amino acid carrier protein  51.02 
 
 		 456 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2767  amino acid carrier protein  48.78 
 
 		 450 aa  391  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.070089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  46.56 
 
 		 447 aa  388  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2656  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  52.61 
 
 		 426 aa  386  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168097  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1973  amino acid carrier protein  46.28 
 
 		 458 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.123631 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  46.14 
 
 		 460 aa  382  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2159  Na+/alanine symporter  49.56 
 
 		 460 aa  382  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  47.65 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  50.44 
 
 		 453 aa  383  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  51.1 
 
 		 453 aa  383  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3038  amino acid carrier protein  49.21 
 
 		 470 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  50.11 
 
 		 448 aa  375  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  50.9 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0060  amino acid carrier protein  43.91 
 
 		 503 aa  373  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.706762 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  48.88 
 
 		 443 aa  369  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0109  amino acid carrier protein  45.86 
 
 		 505 aa  368  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.108225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17880  amino acid carrier protein  46.01 
 
 		 492 aa  364  2e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0461  D-alanine glycine permease  49.78 
 
 		 458 aa  363  3e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0104177  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1336  amino acid carrier protein  44.37 
 
 		 457 aa  362  6e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000270325  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  47.66 
 
 		 458 aa  360  2e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12690  amino acid carrier protein  43.66 
 
 		 498 aa  359  7e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1827  branched-chain amino acid transport protein  42.48 
 
 		 472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2251  sodium:alanine symporter  47.93 
 
 		 490 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1133  amino acid carrier protein  48.26 
 
 		 456 aa  355  1e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  50.82 
 
 		 424 aa  351  1e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0666  amino acid carrier protein  49.27 
 
 		 487 aa  350  4e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.761891  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1016  amino acid carrier protein  42.27 
 
 		 471 aa  340  2e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.190269  normal  0.164712 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0368  amino acid carrier protein  40.9 
 
 		 451 aa  336  5.999999999999999e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000970174  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0040  amino acid carrier protein  44.62 
 
 		 469 aa  333  5e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.489781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>